CDIP1

CDIP1
Ідентифікатори
Символи	CDIP1, C16orf5, CDIP, I1, LITAFL, cell death-inducing p53 target 1, cell death inducing p53 target 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610503 MGI: 1913876 HomoloGene: 40879 GeneCards: CDIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція Клітинна компонента • клітинне ядро • cytoplasmic side of late endosome membrane • cytoplasmic side of lysosomal membrane • мембрана • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • late endosome membrane Біологічний процес • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29965	66626
Ensembl	ENSG00000089486 ENSG00000274336	ENSMUSG00000004071
UniProt	Q9H305	Q9DB75
RefSeq (мРНК)	NM_001199054 NM_001199055 NM_001199056 NM_013399	NM_025670
RefSeq (білок)	NP_001185983 NP_001185984 NP_001185985 NP_037531	NP_079946 NP_001345007 NP_001345008 NP_001345009 NP_001345010 NP_001345011
Локус (UCSC)	Хр. 16: 4.51 – 4.54 Mb	Хр. 16: 4.75 – 4.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDIP1 (англ. Cell death inducing p53 target 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 21 892.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSEPPPPYP		GGPTAPLLEE		KSGAPPTPGR		SSPAVMQPPP		GMPLPPADIG
PPPYEPPGHP		MPQPGFIPPH		MSADGTYMPP		GFYPPPGPHP		PMGYYPPGPY
TPGPYPGPGG		HTATVLVPSG		AATTVTVLQG		EIFEGAPVQT		VCPHCQQAIT
TKISYEIGLM		NFVLGFFCCF		MGCDLGCCLI		PCLINDFKDV		THTCPSCKAY
IYTYKRLC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Bhalla K., Eyre H.J., Whitmore S.A., Sutherland G.R., Callen D.F. (1999). C16orf5, a novel proline-rich gene at 16p13.3, is highly expressed in the brain. J. Hum. Genet. 44: 383—387. PMID 10570909 DOI:10.1007/s100380050183
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Qin W., Wunderley L., Barrett A.L., High S., Woodman P.G. (2016). The Charcot Marie Tooth disease protein LITAF is a zinc-binding monotopic membrane protein. Biochem. J. 473: 3965—3978. PMID 27582497 DOI:10.1042/BCJ20160657

Див. також

• Хромосома 16