CDK5RAP1

CDK5RAP1
Ідентифікатори
Символи	CDK5RAP1, C20orf34, C42, CGI-05, HSPC167, CDK5 regulatory subunit associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608200 MGI: 1914221 HomoloGene: 9502 GeneCards: CDK5RAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • transferase activity • iron-sulfur cluster binding • каталітична активність • protein kinase binding • зв'язування з іоном металу • N6-isopentenyladenosine methylthiotransferase activity • 4 iron, 4 sulfur cluster binding Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • компонент клітини Біологічний процес • regulation of neuron differentiation • brain development • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • tRNA modification • positive regulation of mitochondrial translation • mitochondrial tRNA modification • positive regulation of translational fidelity • tRNA methylthiolation • GO:0016547 Редагування РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51654	66971
Ensembl	ENSG00000101391	ENSMUSG00000027487
UniProt	Q96SZ6	Q8BTW8
RefSeq (мРНК)	NM_001278167 NM_001278168 NM_001278169 NM_016082 NM_016408 NM_001365728	NM_025876
RefSeq (білок)	NP_001265096 NP_001265097 NP_001265098 NP_057166 NP_057492 NP_001352657	NP_080152
Локус (UCSC)	Хр. 20: 33.36 – 33.4 Mb	Хр. 2: 154.18 – 154.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDK5RAP1 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 601 амінокислот, а молекулярна маса — 67 689.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHPLQCVLQV		QRSLGWGPLA		SVSWLSLRMC		RAHSSLSSTM		CPSPERQEDG
ARKDFSSRLA		AGPTFQHFLK		SASAPQEKLS		SEVEDPPPYL		MMDELLGRQR
KVYLETYGCQ		MNVNDTEIAW		SILQKSGYLR		TSNLQEADVI		LLVTCSIREK
AEQTIWNRLH		QLKALKTRRP		RSRVPLRIGI		LGCMAERLKE		EILNREKMVD
ILAGPDAYRD		LPRLLAVAES		GQQAANVLLS		LDETYADVMP		VQTSASATSA
FVSIMRGCDN		MCSYCIVPFT		RGRERSRPIA		SILEEVKKLS		EQVFLPPRPP
KVLGLQGLKE		VTLLGQNVNS		FRDNSEVQFN		SAVPTNLSRG		FTTNYKTKQG
GLRFAHLLDQ		VSRVDPEMRI		RFTSPHPKDF		PDEVLQLIHE		RDNICKQIHL
PAQSGSSRVL		EAMRRGYSRE		AYVELVHHIR		ESIPGVSLSS		DFIAGFCGET
EEDHVQTVSL		LREVQYNMGF		LFAYSMRQKT		RAYHRLKDDV		PEEVKLRRLE
ELITIFREEA		TKANQTSVGC		TQLVLVEGLS		KRSATDLCGR		NDGNLKVIFP
DAEMEDVNNP		GLRVRAQPGD		YVLVKITSAS		SQTLRGHVLC		RTTLRDSSAY
C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою, S-аденозил-L-метіоніном.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
• Ching Y.-P., Pang A.S.H., Lam W.-H., Qi R.Z., Wang J.H. (2002). Identification of a neuronal Cdk5 activator-binding protein as Cdk5 inhibitor. J. Biol. Chem. 277: 15237—15240. PMID 11882646 DOI:10.1074/jbc.C200032200

Див. також

• Хромосома 20