CERK

CERK
Ідентифікатори
Символи	CERK, LK4, dA59H18.2, dA59H18.3, hceramide kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 610307 MGI: 2386052 HomoloGene: 11247 GeneCards: CERK
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • magnesium ion binding • kinase activity • ceramide kinase activity • NAD+ kinase activity • dihydroceramide kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • мітохондрія Біологічний процес • glycosphingolipid metabolic process • ceramide metabolic process • фосфорилювання • lipid phosphorylation • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64781	223753
Ensembl	ENSG00000100422	ENSMUSG00000035891
UniProt	Q8TCT0	Q8K4Q7
RefSeq (мРНК)	NM_022766 NM_182661	NM_145475
RefSeq (білок)	NP_073603 NP_073603.2	NP_663450
Локус (UCSC)	Хр. 22: 46.68 – 46.74 Mb	Хр. 15: 86.14 – 86.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CERK (англ. Ceramide kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 537 амінокислот, а молекулярна маса — 59 977.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGATGAAEPL		QSVLWVKQQR		CAVSLEPARA		LLRWWRSPGP		GAGAPGADAC
SVPVSEIIAV		EETDVHGKHQ		GSGKWQKMEK		PYAFTVHCVK		RARRHRWKWA
QVTFWCPEEQ		LCHLWLQTLR		EMLEKLTSRP		KHLLVFINPF		GGKGQGKRIY
ERKVAPLFTL		ASITTDIIVT		EHANQAKETL		YEINIDKYDG		IVCVGGDGMF
SEVLHGLIGR		TQRSAGVDQN		HPRAVLVPSS		LRIGIIPAGS		TDCVCYSTVG
TSDAETSALH		IVVGDSLAMD		VSSVHHNSTL		LRYSVSLLGY		GFYGDIIKDS
EKKRWLGLAR		YDFSGLKTFL		SHHCYEGTVS		FLPAQHTVGS		PRDRKPCRAG
CFVCRQSKQQ		LEEEQKKALY		GLEAAEDVEE		WQVVCGKFLA		INATNMSCAC
RRSPRGLSPA		AHLGDGSSDL		ILIRKCSRFN		FLRFLIRHTN		QQDQFDFTFV
EVYRVKKFQF		TSKHMEDEDS		DLKEGGKKRF		GHICSSHPSC		CCTVSNSSWN
CDGEVLHSPA		IEVRVHCQLV		RLFARGIEEN		PKPDSHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 doi:10.1093/dnares/8.1.1
• Kim T.J., Mitsutake S., Kato M., Igarashi Y. (2005). The leucine 10 residue in the pleckstrin homology domain of ceramide kinase is crucial for its catalytic activity. FEBS Lett. 579: 4383—4388. PMID 16081073 doi:10.1016/j.febslet.2005.06.079
• Don A.S., Rosen H. (2009). A lipid binding domain in sphingosine kinase 2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 380: 87—92. PMID 19168031 doi:10.1016/j.bbrc.2009.01.075

Див. також

• Хромосома 22