CFD

CFD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BIO, 1DFP, 1DIC, 1DST, 1DSU, 1FDP, 1HFD, 2XW9, 2XWA, 2XWB, 4CBN, 4CBO, 4D9R
Ідентифікатори
Символи	CFD, ADIPSIN, ADN, DF, PFD, complement factor D
Зовнішні ІД	OMIM: 134350 MGI: 87931 HomoloGene: 20453 GeneCards: CFD
Пов'язані генетичні захворювання
recurrent Neisseria infections due to factor D deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • platelet alpha granule lumen • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • міжклітинний простір Біологічний процес • complement activation • platelet degranulation • complement activation, alternative pathway • протеоліз • процес імунної системи • вроджений імунітет • neutrophil degranulation • Сигнальний шлях Notch Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1675	11537
Ensembl	ENSG00000274619 ENSG00000197766	ENSMUSG00000061780
UniProt	P00746	P03953
RefSeq (мРНК)	NM_001928 NM_001317335	NM_001291915 NM_013459 NM_001329541
RefSeq (білок)	NP_001304264 NP_001919	NP_001278844 NP_001316470 NP_038487
Локус (UCSC)	Хр. 19: 0.86 – 0.87 Mb	Хр. 10: 79.73 – 79.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CFD (англ. Complement factor D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 253 амінокислот, а молекулярна маса — 27 033.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHSWERLAVL		VLLGAAACAA		PPRGRILGGR		EAEAHARPYM		ASVQLNGAHL
CGGVLVAEQW		VLSAAHCLED		AADGKVQVLL		GAHSLSQPEP		SKRLYDVLRA
VPHPDSQPDT		IDHDLLLLQL		SEKATLGPAV		RPLPWQRVDR		DVAPGTLCDV
AGWGIVNHAG		RRPDSLQHVL		LPVLDRATCN		RRTHHDGAIT		ERLMCAESNR
RDSCKGDSGG		PLVCGGVLEG		VVTSGSRVCG		NRKKPGIYTR		VASYAAWIDS
VLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний шлях активації комплементу. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Niemann M.A., Bhown A.S., Bennett J.C., Volanakis J.E. (1984). Amino acid sequence of human D of the alternative complement pathway. Biochemistry. 23: 2482—2486. PMID 6383466 DOI:10.1021/bi00306a025
• Johnson D.M.A., Gagnon J., Reid K.B.M. (1984). Amino acid sequence of human factor D of the complement system. Similarity in sequence between factor D and proteases of non-plasma origin. FEBS Lett. 166: 347—351. PMID 6363133 DOI:10.1016/0014-5793(84)80110-6
• Volanakis J.E., Bhown A.S., Bennett J.C., Mole J.E. (1980). Partial amino acid sequence of human factor D: homology with serine proteases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77: 1116—1119. PMID 6987665 DOI:10.1073/pnas.77.2.1116
• Davis A.E. III (1980). Active site amino acid sequence of human factor D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77: 4938—4942. PMID 6776531 DOI:10.1073/pnas.77.8.4938
• Johnson D.M.A., Gagnon J., Reid K.B.M. (1980). Factor D of the alternative pathway of human complement. Purification, alignment and N-terminal amino acid sequences of the major cyanogen bromide fragments, and localization of the serine residue at the active site. Biochem. J. 187: 863—874. PMID 6821372 DOI:10.1042/bj1870863

Див. також

• Хромосома 19