CHMP1A

CHMP1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JQ9, 2YMB, 4A5X
Ідентифікатори
Символи	CHMP1A, CHMP1, PCH8, PCOLN3, PRSM1, VPS46-1, VPS46A, charged multivesicular body protein 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 164010 MGI: 1920159 HomoloGene: 56240 GeneCards: CHMP1A
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 8
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • metallopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • мембрана • центр організації мікротрубочок • condensed nuclear chromosome • early endosome • endosome membrane • екзосома • система ендомембран • клітинне ядро • nuclear matrix • ESCRT III complex • multivesicular body Біологічний процес • carbon catabolite repression of transcription by glucose • regulation of centrosome duplication • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral budding via host ESCRT complex • nucleus organization • multivesicular body assembly • regulation of mitotic spindle assembly • transcription, DNA-templated • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • vacuolar transport • ESCRT III complex disassembly • протеоліз • mitotic chromosome condensation • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • negative regulation of cell cycle • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5119	234852
Ensembl	ENSG00000131165	ENSMUSG00000000743
UniProt	Q9HD42	Q921W0
RefSeq (мРНК)	NM_001083314 NM_002768	NM_145606
RefSeq (білок)	NP_001076783 NP_002759	NP_663581
Локус (UCSC)	Хр. 16: 89.64 – 89.66 Mb	Хр. 8: 123.93 – 123.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHMP1A (англ. Charged multivesicular body protein 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 21 703.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDTLFQLKF		TAKQLEKLAK		KAEKDSKAEQ		AKVKKALLQK		NVECARVYAE
NAIRKKNEGV		NWLRMASRVD		AVASKVQTAV		TMKGVTKNMA		QVTKALDKAL
STMDLQKVSS		VMDRFEQQVQ		NLDVHTSVME		DSMSSATTLT		TPQEQVDSLI
MQIAEENGLE		VLDQLSQLPE		GASAVGESSV		RSQEDQLSRR		LAALRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Stauffer D.R., Howard T.L., Nyun T., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 is a novel nuclear matrix protein affecting chromatin structure and cell-cycle progression. J. Cell Sci. 114: 2383—2393. PMID 11559747
• Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 152845—152845. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 16