CHRFAM7A

CHRFAM7A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5AFK, 5AFJ, 5AFL, 2MAW, 5AFN, 5AFM, 5AFH
Ідентифікатори
Символи	CHRFAM7A, CHRNA7, CHRNA7-DR1, D-10, CHRNA7 (exons 5-10) and FAM7A (exons A-E) fusion, NACHRA7
Зовнішні ІД	OMIM: 609756 MGI: 99779 GeneCards: CHRFAM7A
Реагує на сполуку
	encenicline, PNU-120596, mecamylamine, AZD0328, encenicline
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular ligand-gated ion channel activity; • ion channel activity; • transmembrane signaling receptor activity; • acetylcholine receptor activity; • acetylcholine binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein homodimerization activity; • acetylcholine-gated cation-selective channel activity; • amyloid-beta binding; • chloride channel regulator activity; • toxic substance binding; • ligand-gated ion channel activity; • calcium channel activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • acetylcholine-gated channel complex; • neuron projection; • синапс; • postsynaptic membrane; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • plasma membrane raft; • postsynapse;
Біологічний процес	• ion transmembrane transport; • ion transport; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • chemical synaptic transmission; • synaptic transmission, cholinergic; • regulation of membrane potential; • nervous system process; • response to hypoxia; • когнітивність; • cellular calcium ion homeostasis; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of cell population proliferation; • GO:0015915 транспорт; • calcium ion transport; • пам'ять; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • response to nicotine; • regulation of postsynaptic membrane potential; • excitatory postsynaptic potential; • positive regulation of protein phosphorylation; • learning or memory; • короткочасна пам'ять; • synapse organization; • sensory processing; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • calcium ion transmembrane transport; • acetylcholine receptor signaling pathway; • dendritic spine organization; • modulation of excitatory postsynaptic potential; • dendrite arborization; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • regulation of neuron death; • positive regulation of amyloid-beta formation; • negative regulation of amyloid-beta formation; • regulation of amyloid precursor protein catabolic process; • response to amyloid-beta; • response to acetylcholine; • regulation of amyloid fibril formation; • positive regulation of CoA-transferase activity; • positive regulation of excitatory postsynaptic potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	89832
	11441
	ENSG00000275917; ENSG00000166664
	ENSMUSG00000030525
	Q494W8; P36544
	P49582
	NM_139320; NM_148911
	NM_007390
	NP_647536; NP_683709; NP_000737; NP_001177384
	NP_031416
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHRFAM7A (англ. CHRNA7-FAM7A fusion protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 46 218^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQKYCIYQHF	QFQLLIQHLW	IAANCDIADE	RFDATFHTNV	LVNSSGHCQY
LPPGIFKSSC	YIDVRWFPFD	VQHCKLKFGS	WSYGGWSLDL	QMQEADISGY
IPNGEWDLVG	IPGKRSERFY	ECCKEPYPDV	TFTVTMRRRT	LYYGLNLLIP
CVLISALALL	VFLLPADSGE	KISLGITVLL	SLTVFMLLVA	EIMPATSDSV
PLIAQYFAST	MIIVGLSVVV	TVIVLQYHHH	DPDGGKMPKW	TRVILLNWCA
WFLRMKRPGE	DKVRPACQHK	QRRCSLASVE	MSAVAPPPAS	NGNLLYIGFR
GLDGVHCVPT	PDSGVVCGRM	ACSPTHDEHL	LHGGQPPEGD	PDLAKILEEV
RYIANRFRCQ	DESEAVCSEW	KFAACVVDRL	CLMAFSVFTI	ICTIGILMSA
PNFVEAVSKD	FA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15781 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q494W8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15781 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q494W8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]