CLC

CLC
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1G86, 1HDK, 1LCL, 1QKQ
Ідентифікатори
Символи	CLC, GAL10, Gal-10, LGALS10, LGALS10A, LPPL_HUMAN, Charcot-Leyden crystal galectin, galectin-10
Зовнішні ІД	OMIM: 153310 HomoloGene: 130498 GeneCards: CLC
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • lysophospholipase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • multicellular organism development • T cell apoptotic process • regulation of T cell cytokine production • regulation of activated T cell proliferation • regulation of T cell anergy Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1178	н/д
Ensembl	ENSG00000105205	н/д
UniProt	Q05315	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001828	н/д
RefSeq (білок)	NP_001819	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.73 – 39.74 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

CLC (англ. Charcot-Leyden crystal galectin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 453.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLLPVPYTE		AASLSTGSTV		TIKGRPLACF		LNEPYLQVDF		HTEMKEESDI
VFHFQVCFGR		RVVMNSREYG		AWKQQVESKN		MPFQDGQEFE		LSISVLPDKY
QVMVNGQSSY		TFDHRIKPEA		VKMVQVWRDI		SLTKFNVSYL		KR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Dyer K.D., Handen J.S., Rosenberg H.F. (1997). The genomic structure of the human Charcot-Leyden crystal protein gene is analogous to those of the galectin genes. Genomics. 40: 217—221. PMID 9119387 DOI:10.1006/geno.1996.4590
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ghafouri B., Irander K., Lindbom J., Tagesson C., Lindahl M. (2006). Comparative proteomics of nasal fluid in seasonal allergic rhinitis. J. Proteome Res. 5: 330—338. PMID 16457599 DOI:10.1021/pr050341h
• Chua J.C., Douglass J.A., Gillman A., O'Hehir R.E., Meeusen E.N. (2012). Galectin-10, a potential biomarker of eosinophilic airway inflammation. PLoS ONE. 7: E42549—E42549. PMID 22880030 DOI:10.1371/journal.pone.0042549
• Swaminathan G.J., Leonidas D.D., Savage M.P., Ackerman S.J., Acharya K.R. (1999). Selective recognition of mannose by the human eosinophil Charcot-Leyden crystal protein (galectin-10): a crystallographic study at 1.8 A resolution. Biochemistry. 38: 13837—13843. PMID 10529229 DOI:10.1021/bi990756e

Див. також

• Хромосома 19