CLDN1

CLDN1
Ідентифікатори
Символи	CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity • identical protein binding • virus receptor activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • lateral plasma membrane • bicellular tight junction • цитоплазма • basolateral plasma membrane Біологічний процес • viral entry into host cell • cell-cell junction organization • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • protein heterooligomerization • establishment of skin barrier • bicellular tight junction assembly • GO:0010260 старіння людини • establishment of blood-nerve barrier • response to toxic substance • response to lipopolysaccharide • hyperosmotic salinity response • response to ethanol • xenobiotic transport across blood-nerve barrier • response to interleukin-18 • cellular response to lead ion • cellular response to interferon-gamma • cellular response to tumor necrosis factor • response to dexamethasone • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • establishment of endothelial intestinal barrier • liver regeneration • positive regulation of bicellular tight junction assembly • cellular response to butyrate Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9076	12737
Ensembl	ENSG00000163347	ENSMUSG00000022512
UniProt	O95832	O88551
RefSeq (мРНК)	NM_021101	NM_016674
RefSeq (білок)	NP_066924	NP_057883
Локус (UCSC)	Хр. 3: 190.31 – 190.32 Mb	Хр. 16: 26.18 – 26.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLDN1 (англ. Claudin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 22 744.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANAGLQLLG		FILAFLGWIG		AIVSTALPQW		RIYSYAGDNI		VTAQAMYEGL
WMSCVSQSTG		QIQCKVFDSL		LNLSSTLQAT		RALMVVGILL		GVIAIFVATV
GMKCMKCLED		DEVQKMRMAV		IGGAIFLLAG		LAILVATAWY		GNRIVQEFYD
PMTPVNARYE		FGQALFTGWA		AASLCLLGGA		LLCCSCPRKT		TSYPTPRPYP
KPAPSSGKDY		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• Kraemer F., White K., Kubbies M., Swisshelm K.L., Weber B.H.F. (2000). Genomic organization of claudin-1 and its assessment in hereditary and sporadic breast cancer. Hum. Genet. 107: 249—256. PMID 11071387 DOI:10.1007/s004390000375
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Che P., Tang H., Li Q. (2013). The interaction between claudin-1 and dengue viral prM/M protein for its entry. Virology. 446: 303—313. PMID 24074594 DOI:10.1016/j.virol.2013.08.009

Див. також

• Хромосома 3