CLEC16A

CLEC16A
Ідентифікатори
Символи	CLEC16A, Gop-1, KIAA0350, C-type lectin domain family 16 member A, C-type lectin domain containing 16A
Зовнішні ІД	OMIM: 611303 MGI: 1921624 HomoloGene: 71019 GeneCards: CLEC16A
Пов'язані генетичні захворювання
системний червоний вовчак, ожиріння, атопічний дерматит, поліноз, розсіяний склероз, цукровий діабет тип 1, primary biliary cholangitis
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • lysosomal membrane • ендосома • лізосома • endosome membrane • мембрана • endolysosome membrane • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • везикула • late endosome • integral component of membrane Біологічний процес • автофагія • positive regulation of autophagosome maturation • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of mitophagy • cellular response to starvation • negative regulation of autophagosome maturation • positive regulation of TORC1 signaling • negative regulation of macroautophagy by TORC1 signaling • endosome to lysosome transport • endosomal transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23274	74374
Ensembl	ENSG00000038532	ENSMUSG00000068663
UniProt	Q2KHT3	Q80U30
RefSeq (мРНК)	NM_001243403 NM_015226	NM_001204229 NM_177562
RefSeq (білок)	NP_001230332 NP_056041	NP_001191158 NP_808230
Локус (UCSC)	Хр. 16: 10.94 – 11.18 Mb	Хр. 16: 10.36 – 10.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC16A (англ. C-type lectin domain containing 16A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 053 амінокислот, а молекулярна маса — 117 715.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFGRSRSWVG		GGHGKTSRNI		HSLDHLKYLY		HVLTKNTTVT		EQNRNLLVET
IRSITEILIW		GDQNDSSVFD		FFLEKNMFVF		FLNILRQKSG		RYVCVQLLQT
LNILFENISH		ETSLYYLLSN		NYVNSIIVHK		FDFSDEEIMA		YYISFLKTLS
LKLNNHTVHF		FYNEHTNDFA		LYTEAIKFFN		HPESMVRIAV		RTITLNVYKV
SLDNQAMLHY		IRDKTAVPYF		SNLVWFIGSH		VIELDDCVQT		DEEHRNRGKL
SDLVAEHLDH		LHYLNDILII		NCEFLNDVLT		DHLLNRLFLP		LYVYSLENQD
KGGERPKISL		PVSLYLLSQV		FLIIHHAPLV		NSLAEVILNG		DLSEMYAKTE
QDIQRSSAKP		SIRCFIKPTE		TLERSLEMNK		HKGKRRVQKR		PNYKNVGEEE
DEEKGPTEDA		QEDAEKAKGT		EGGSKGIKTS		GESEEIEMVI		MERSKLSELA
ASTSVQEQNT		TDEEKSAAAT		CSESTQWSRP		FLDMVYHALD		SPDDDYHALF
VLCLLYAMSH		NKGMDPEKLE		RIQLPVPNAA		EKTTYNHPLA		ERLIRIMNNA
AQPDGKIRLA		TLELSCLLLK		QQVLMSAGCI		MKDVHLACLE		GAREESVHLV
RHFYKGEDIF		LDMFEDEYRS		MTMKPMNVEY		LMMDASILLP		PTGTPLTGID
FVKRLPCGDV		EKTRRAIRVF		FMLRSLSLQL		RGEPETQLPL		TREEDLIKTD
DVLDLNNSDL		IACTVITKDG		GMVQRFLAVD		IYQMSLVEPD		VSRLGWGVVK
FAGLLQDMQV		TGVEDDSRAL		NITIHKPASS		PHSKPFPILQ		ATFIFSDHIR
CIIAKQRLAK		GRIQARRMKM		QRIAALLDLP		IQPTTEVLGF		GLGSSTSTQH
LPFRFYDQGR		RGSSDPTVQR		SVFASVDKVP		GFAVAQCINQ		HSSPSLSSQS
PPSASGSPSG		SGSTSHCDSG		GTSSSSTPST		AQSPADAPMS		PELPKPHLPD
QLVIVNETEA		DSKPSKNVAR		SAAVETASLS		PSLVPARQPT		ISLLCEDTAD
TLSVESLTLV		PPVDPHSLRS		LTGMPPLSTP		AAACTEPVGE		EAACAEPVGT
AED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16