CNOT8

CNOT8
Ідентифікатори
Символи	CNOT8, CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603731 MGI: 1916375 HomoloGene: 48304 GeneCards: CNOT8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(A)-specific ribonuclease activity; • 3'-5'-exoribonuclease activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • nuclease activity; • exonuclease activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • CCR4-NOT complex; • внутрішньоклітинний; • клітинне ядро; • P-body; • CCR4-NOT core complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • positive regulation of mRNA catabolic process; • transcription, DNA-templated; • gene silencing by miRNA; • positive regulation of cell population proliferation; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • Сайленсинг генів; • regulation of translation; • negative regulation of cell population proliferation; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • negative regulation of translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9337
	69125
	ENSG00000155508
	ENSMUSG00000020515
	Q9UFF9
	Q9D8X5
NM_001301073; NM_001301074; NM_001301075; NM_001301077; NM_001301080;
	NM_001301082; NM_001301083; NM_001301086; NM_004779
	NM_026949; NM_001356477; NM_001363084; NM_001363085; NM_001363086
NP_001288002; NP_001288003; NP_001288004; NP_001288006; NP_001288009;
	NP_001288011; NP_001288012; NP_001288015; NP_004770
	NP_081225; NP_001343406; NP_001350013; NP_001350014; NP_001350015
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CNOT8 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 292 амінокислот, а молекулярна маса — 33 540^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAALVENSQ	VICEVWASNL	EEEMRKIREI	VLSYSYIAMD	TEFPGVVVRP
IGEFRSSIDY	QYQLLRCNVD	LLKIIQLGLT	FTNEKGEYPS	GINTWQFNFK
FNLTEDMYSQ	DSIDLLANSG	LQFQKHEEEG	IDTLHFAELL	MTSGVVLCDN
VKWLSFHSGY	DFGYMVKLLT	DSRLPEEEHE	FFHILNLFFP	SIYDVKYLMK
SCKNLKGGLQ	EVADQLDLQR	IGRQHQAGSD	SLLTGMAFFR	MKELFFEDSI
DDAKYCGRLY	GLGTGVAQKQ	NEDVDSAQEK	MSILAIINNM	QQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Fidler C., Wainscoat J.S., Boultwood J. (1999). The human POP2 gene: identification, sequencing, and mapping to the critical region of the 5q- syndrome. Genomics. 56: 134—136. PMID 10036195 DOI:10.1006/geno.1998.5687
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9207 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017. {{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UFF9 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9207 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017. {{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UFF9 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]