CNTNAP4

CNTNAP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NXQ
Ідентифікатори
Символи	CNTNAP4, CASPR4, contactin associated protein like 4, contactin associated protein family member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 610518 MGI: 2183572 HomoloGene: 24912 GeneCards: CNTNAP4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • синапс • presynaptic membrane • мембрана • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane Біологічний процес • regulation of synaptic transmission, dopaminergic • regulation of grooming behavior • адгезія клітин • regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:1904739 regulation of synapse organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85445	170571
Ensembl	ENSG00000152910	ENSMUSG00000031772
UniProt	Q9C0A0	Q99P47
RefSeq (мРНК)	NM_033401 NM_138994 NM_001322178 NM_001322179 NM_001322180 NM_001322181 NM_001322187 NM_001322188 NM_001322189 NM_001322190 NM_001322191	NM_130457
RefSeq (білок)	NP_001309107 NP_001309108 NP_001309109 NP_001309110 NP_001309116 NP_001309117 NP_001309118 NP_001309119 NP_001309120 NP_207837 NP_620481	NP_569724
Локус (UCSC)	Хр. 16: 76.28 – 76.56 Mb	Хр. 8: 113.3 – 113.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNTNAP4 (англ. Contactin associated protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 308 амінокислот, а молекулярна маса — 145 274.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSVTGAVLK		TLLLLSTQNW		NRVEAGNSYD		CDDPLVSALP		QASFSSSSEL
SSSHGPGFAR		LNRRDGAGGW		SPLVSNKYQW		LQIDLGERME		VTAVATQGGY
GSSNWVTSYL		LMFSDSGWNW		KQYRQEDSIW		GFSGNANADS		VVYYRLQPSI
KARFLRFIPL		EWNPKGRIGM		RIEVFGCAYR		SEVVDLDGKS		SLLYRFDQKS
LSPIKDIISL		KFKTMQSDGI		LLHREGPNGD		HITLQLRRAR		LFLLINSGEA
KLPSTSTLVN		LTLGSLLDDQ		HWHSVLIQRL		GKQVNFTVDE		HRHHFHARGE
FNLMNLDYEI		SFGGIPAPGK		SVSFPHRNFH		GCLENLYYNG		VDIIDLAKQQ
KPQIIAMGNV		SFSCSQPQSM		PVTFLSSRSY		LALPDFSGEE		EVSATFQFRT
WNKAGLLLFS		ELQLISGGIL		LFLSDGKLKS		NLYQPGKLPS		DITAGVELND
GQWHSVSLSA		KKNHLSVAVD		GQMASAAPLL		GPEQIYSGGT		YYFGGCPDKS
FGSKCKSPLG		GFQGCMRLIS		ISGKVVDLIS		VQQGSLGNFS		DLQIDSCGIS
DRCLPNYCEH		GGECSQSWST		FHCNCTNTGY		RGATCHNSIY		EQSCEAYKHR
GNTSGFYYID		SDGSGPLEPF		LLYCNMTETA		WTIIQHNGSD		LTRVRNTNPE
NPYAGFFEYV		ASMEQLQATI		NRAEHCEQEF		TYYCKKSRLV		NKQDGTPLSW
WVGRTNETQT		YWGGSSPDLQ		KCTCGLEGNC		IDSQYYCNCD		ADRNEWTNDT
GLLAYKEHLP		VTKIVITDTG		RLHSEAAYKL		GPLLCQGDRS		FWNSASFDTE
ASYLHFPTFH		GELSADVSFF		FKTTASSGVF		LENLGIADFI		RIELRSPTVV
TFSFDVGNGP		FEISVQSPTH		FNDNQWHHVR		VERNMKEASL		QVDQLTPKTQ
PAPADGHVLL		QLNSQLFVGG		TATRQRGFLG		CIRSLQLNGM		TLDLEERAQV
TPEVQPGCRG		HCSSYGKLCR		NGGKCRERPI		GFFCDCTFSA		YTGPFCSNEI
SAYFGSGSSV		IYNFQENYLL		SKNSSSHAAS		FHGDMKLSRE		MIKFSFRTTR
TPSLLLFVSS		FYKEYLSVII		AKNGSLQIRY		KLNKYQEPDV		VNFDFKNMAD
GQLHHIMINR		EEGVVFIEID		DNRRRQVHLS		SGTEFSAVKS		LVLGRILEHS
DVDQDTALAG		AQGFTGCLSA		VQLSHVAPLK		AALHPSHPDP		VTVTGHVTES
SCMAQPGTDA		TSRERTHSFA		DHSGTIDDRE		PLANAIKSDS		AVIGGLIAVV
IFILLCITAI		AVRIYQQKRL		YKRSEAKRSE		NVDSAEAVLK		SELNIQNAVN
ENQKEYFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 doi:10.1016/j.str.2013.01.004

Див. також

• Хромосома 16