CPEB1

CPEB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2M13, 2MKH, 2MKK, 2N1O
Ідентифікатори
Символи	CPEB1, CEBP, CPE-BP1, CPEB, CPEB-1, hCPEB-1, h-CPEB, cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607342 MGI: 108442 HomoloGene: 7278 GeneCards: CPEB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding; • translation factor activity, RNA binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • ribosome binding; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • mRNA 3'-UTR binding; • translation regulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• синапс; • cell projection; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • messenger ribonucleoprotein complex; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • postsynaptic membrane; • мембрана; • P-body; • дендрит (нейробіологія); • клітинна мембрана; • цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• cellular response to insulin stimulus; • regulation of translation; • negative regulation of cytoplasmic translation; • mRNA processing; • cellular response to amino acid stimulus; • cellular response to hypoxia; • Біосинтез білків; • positive regulation of mRNA polyadenylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64506
	12877
	ENSG00000277445; ENSG00000214575
	ENSMUSG00000025586
	Q9BZB8
	P70166
NM_030594; NM_001079533; NM_001079534; NM_001079535; NM_001288819;
	NM_001288820
	NM_001252525; NM_001252526; NM_007755; NM_001357107
NP_001073001; NP_001073002; NP_001073003; NP_001275748; NP_001275749;
	NP_085097; NP_001352169; NP_001352170; NP_001352171; NP_001352172; NP_001352173; NP_001352174; NP_001352175; NP_001352176; NP_001352177; NP_001352178; NP_001352179
	NP_001239454; NP_001239455; NP_031781; NP_001344036
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CPEB1 (англ. Cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 62 595^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSLEEEAG	RIKDCWDNQE	APALSTCSNA	NIFRRINAIL	DNSLDFSRVC
TTPINRGIHD	HLPDFQDSEE	TVTSRMLFPT	SAQESSRGLP	DANDLCLGLQ
SLSLTGWDRP	WSTQDSDSSA	QSSTHSVLSM	LHNPLGNVLG	KPPLSFLPLD
PLGSDLVDKF	PAPSVRGSRL	DTRPILDSRS	SSPSDSDTSG	FSSGSDHLSD
LISSLRISPP	LPFLSLSGGG	PRDPLKMGVG	SRMDQEQAAL	AAVTPSPTSA
SKRWPGASVW	PSWDLLEAPK	DPFSIEREAR	LHRQAAAVNE	ATCTWSGQLP
PRNYKNPIYS	CKVFLGGVPW	DITEAGLVNT	FRVFGSLSVE	WPGKDGKHPR
CPPKGNMPKG	YVYLVFELEK	SVRSLLQACS	HDPLSPDGLS	EYYFKMSSRR
MRCKEVQVIP	WVLADSNFVR	SPSQRLDPSR	TVFVGALHGM	LNAEALAAIL
NDLFGGVVYA	GIDTDKHKYP	IGSGRVTFNN	QRSYLKAVSA	AFVEIKTTKF
TKKVQIDPYL	EDSLCHICSS	QPGPFFCRDQ	VCFKYFCRSC	WHWRHSMEGL
RHHSPLMRNQ	KNRDSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Welk J.F., Charlesworth A., Smith G.D., MacNicol A.M. (2001). Identification and characterization of the gene encoding human cytoplasmic polyadenylation element binding protein. Gene. 263: 113—120. PMID 11223249 doi:10.1016/S0378-1119(00)00588-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wilczynska A., Aigueperse C., Kress M., Dautry F., Weil D. (2005). The translational regulator CPEB1 provides a link between dcp1 bodies and stress granules. J. Cell Sci. 118: 981—992. PMID 15731006 doi:10.1242/jcs.01692
Giangarra V., Igea A., Castellazzi C.L., Bava F.A., Mendez R. (2015). Global analysis of CPEBs reveals sequential and non-redundant functions in mitotic cell cycle. PLoS ONE. 10: E0138794—E0138794. PMID 26398195 doi:10.1371/journal.pone.0138794
Schelhorn C., Martin-Malpartida P., Sunol D., Macias M.J. (2015). Structural Analysis of the Pin1-CPEB1 interaction and its potential role in CPEB1 degradation. Sci. Rep. 5: 14990—14990. PMID 26456073 doi:10.1038/srep14990

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21744 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BZB8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.