CPEB3

CPEB3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DNL, 2RUG
Ідентифікатори
Символи	CPEB3, cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 610606 MGI: 2443075 HomoloGene: 40992 GeneCards: CPEB3
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding • nucleic acid binding • translation factor activity, RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA stem-loop binding • RNA binding • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • ribosome binding • mRNA 3'-UTR binding • translation regulator activity Клітинна компонента • messenger ribonucleoprotein complex • CCR4-NOT complex • neuron projection • apical dendrite • клітинне ядро • цитоплазма • клітинна мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • cell projection • синапс • postsynaptic membrane • postsynapse Біологічний процес • positive regulation of dendritic spine development • negative regulation of translation • довготривала пам'ять • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • regulation of synaptic plasticity • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cytoplasmic translation • regulation of dendritic spine development • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA polyadenylation • negative regulation of cytoplasmic translational elongation • cellular response to amino acid stimulus • Біосинтез білків • regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22849	208922
Ensembl	ENSG00000107864	ENSMUSG00000039652
UniProt	Q8NE35	Q7TN99
RefSeq (мРНК)	NM_001178137 NM_014912	NM_001290826 NM_001290827 NM_001290828 NM_001290829 NM_198300
RefSeq (білок)	NP_001171608 NP_055727	NP_001277755 NP_001277756 NP_001277757 NP_001277758 NP_938042
Локус (UCSC)	Хр. 10: 92.05 – 92.29 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CPEB3 (англ. Cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 698 амінокислот, а молекулярна маса — 76 014.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQDDLLMDKS		KTQPQPQQQQ		RQQQQPQPES		SVSEAPSTPL		SSETPKPEEN
SAVPALSPAA		APPAPNGPDK		MQMESPLLPG		LSFHQPPQQP		PPPQEPAAPG
ASLSPSFGST		WSTGTTNAVE		DSFFQGITPV		NGTMLFQNFP		HHVNPVFGGT
FSPQIGLAQT		QHHQQPPPPA		PAPQPAQPAQ		PPQAQPPQQR		RSPASPSQAP
YAQRSAAAAY		GHQPIMTSKP		SSSSAVAAAA		AAAAASSASS		SWNTHQSVNA
AWSAPSNPWG		GLQAGRDPRR		AVGVGVGVGV		GVPSPLNPIS		PLKKPFSSNV
IAPPKFPRAA		PLTSKSWMED		NAFRTDNGNN		LLPFQDRSRP		YDTFNLHSLE
NSLMDMIRTD		HEPLKGKHYP		PSGPPMSFAD		IMWRNHFAGR		MGINFHHPGT
DNIMALNNAF		LDDSHGDQAL		SSGLSSPTRC		QNGERVERYS		RKVFVGGLPP
DIDEDEITAS		FRRFGPLVVD		WPHKAESKSY		FPPKGYAFLL		FQEESSVQAL
IDACLEEDGK		LYLCVSSPTI		KDKPVQIRPW		NLSDSDFVMD		GSQPLDPRKT
IFVGGVPRPL		RAVELAMIMD		RLYGGVCYAG		IDTDPELKYP		KGAGRVAFSN
QQSYIAAISA		RFVQLQHNDI		DKRVEVKPYV		LDDQMCDECQ		GTRCGGKFAP
FFCANVTCLQ		YYCEYCWASI		HSRAGREFHK		PLVKEGGDRP		RHVPFRWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Salehi-Ashtiani K., Luptak A., Litovchick A., Szostak J.W. (2006). A genomewide search for ribozymes reveals an HDV-like sequence in the human CPEB3 gene. Science. 313: 1788—1792. PMID 16990549 DOI:10.1126/science.1129308
• Peng S.C., Lai Y.T., Huang H.Y., Huang H.D., Huang Y.S. (2010). A novel role of CPEB3 in regulating EGFR gene transcription via association with Stat5b in neurons. Nucleic Acids Res. 38: 7446—7457. PMID 20639532 DOI:10.1093/nar/gkq634
• Chen Y.C., Sargsyan K., Wright J.D., Huang Y.S., Lim C. (2014). Identifying RNA-binding residues based on evolutionary conserved structural and energetic features. Nucleic Acids Res. 42: E15—E15. PMID 24343026 DOI:10.1093/nar/gkt1299
• Giangarra V., Igea A., Castellazzi C.L., Bava F.A., Mendez R. (2015). Global analysis of CPEBs reveals sequential and non-redundant functions in mitotic cell cycle. PLoS ONE. 10: E0138794—E0138794. PMID 26398195 DOI:10.1371/journal.pone.0138794

Див. також

• Хромосома 10