CPNE1

CPNE1
Ідентифікатори
Символи	CPNE1, COPN1, CPN1, copine 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604205 MGI: 2386621 HomoloGene: 36501 GeneCards: CPNE1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • protein homodimerization activity; • transporter activity; • endopeptidase activity; • phosphatidylserine binding; • NF-kappaB binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium-dependent phospholipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • екзосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерна мембрана; • azurophil granule membrane;
Біологічний процес	• cellular response to calcium ion; • диференціація клітин; • positive regulation of protein kinase B signaling; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • lipid metabolism; • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • negative regulation of DNA binding; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • протеоліз; • neuron projection extension; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • glycerophospholipid biosynthetic process; • positive regulation of neuron differentiation; • vesicle-mediated transport; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8904
	266692
	ENSG00000214078
	ENSMUSG00000074643
	Q99829; Q5JX58
	Q8C166
NM_001198863; NM_003915; NM_152925; NM_152926; NM_152927;
	NM_152928; NM_152930; NM_152931
	NM_170588; NM_170590
NP_001185792; NP_003906; NP_690902; NP_690903; NP_690904;
	NP_690905
	NP_733467; NP_733469
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CPNE1 (англ. Copine 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 537 амінокислот, а молекулярна маса — 59 059^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHCVTLVQL	SISCDHLIDK	DIGSKSDPLC	VLLQDVGGGS	WAELGRTERV
RNCSSPEFSK	TLQLEYRFET	VQKLRFGIYD	IDNKTPELRD	DDFLGGAECS
LGQIVSSQVL	TLPLMLKPGK	PAGRGTITVS	AQELKDNRVV	TMEVEARNLD
KKDFLGKSDP	FLEFFRQGDG	KWHLVYRSEV	IKNNLNPTWK	RFSVPVQHFC
GGNPSTPIQV	QCSDYDSDGS	HDLIGTFHTS	LAQLQAVPAE	FECIHPEKQQ
KKKSYKNSGT	IRVKICRVET	EYSFLDYVMG	GCQINFTVGV	DFTGSNGDPS
SPDSLHYLSP	TGVNEYLMAL	WSVGSVVQDY	DSDKLFPAFG	FGAQVPPDWQ
VSHEFALNFN	PSNPYCAGIQ	GIVDAYRQAL	PQVRLYGPTN	FAPIINHVAR
FAAQAAHQGT	ASQYFMLLLL	TDGAVTDVEA	TREAVVRASN	LPMSVIIVGV
GGADFEAMEQ	LDADGGPLHT	RSGQAAARDI	VQFVPYRRFQ	NAPREALAQT
VLAEVPTQLV	SYFRAQGWAP	LKPLPPSAKD	PAQAPQA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tomsig J.L., Snyder S.L., Creutz C.E. (2003). Identification of targets for calcium signaling through the copine family of proteins. Characterization of a coiled-coil copine-binding motif. J. Biol. Chem. 278: 10048—10054. PMID 12522145 DOI:10.1074/jbc.M212632200
Tomsig J.L., Sohma H., Creutz C.E. (2004). Calcium-dependent regulation of tumour necrosis factor-alpha receptor signalling by copine. Biochem. J. 378: 1089—1094. PMID 14674885 DOI:10.1042/BJ20031654
Creutz C.E., Edwardson J.M. (2009). Organization and synergistic binding of copine I and annexin A1 on supported lipid bilayers observed by atomic force microscopy. Biochim. Biophys. Acta. 1788: 1950—1961. PMID 19539605 DOI:10.1016/j.bbamem.2009.06.009