CROT

CROT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XL7, 1XL8, 1XMC, 1XMD
Ідентифікатори
Символи	CROT, COT, carnitine O-octanoyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 606090 MGI: 1921364 HomoloGene: 10899 GeneCards: CROT
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • signaling receptor binding • acyltransferase activity • carnitine O-octanoyltransferase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • пероксисома • peroxisomal matrix • гіалоплазма Біологічний процес • medium-chain fatty acid metabolic process • coenzyme A metabolic process • lipid metabolism • fatty acid transport • generation of precursor metabolites and energy • fatty acid metabolic process • fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase • fatty acid beta-oxidation • carnitine metabolic process • protein targeting to peroxisome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54677	74114
Ensembl	ENSG00000005469	ENSMUSG00000003623
UniProt	Q9UKG9	Q9DC50
RefSeq (мРНК)	NM_001143935 NM_001243745 NM_021151	NM_023733
RefSeq (білок)	NP_001137407 NP_001230674 NP_066974	NP_076222
Локус (UCSC)	Хр. 7: 87.35 – 87.4 Mb	Хр. 5: 9.02 – 9.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CROT (англ. Carnitine O-octanoyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 70 178.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENQLAKSTE		ERTFQYQDSL		PSLPVPSLEE		SLKKYLESVK		PFANQEEYKK
TEEIVQKFQS		GIGEKLHQKL		LERAKGKRNW		LEEWWLNVAY		LDVRIPSQLN
VNFAGPAAHF		EHYWPPKEGT		QLERGSITLW		HNLNYWQLLR		KEKVPVHKVG
NTPLDMNQFR		MLFSTCKVPG		ITRDSIMNYF		RTESEGRSPN		HIVVLCRGRA
FVFDVIHEGC		LVTPPELLRQ		LTYIHKKCHS		EPDGPGIAAL		TSEERTRWAK
AREYLIGLDP		ENLALLEKIQ		SSLLVYSMED		SSPHVTPEDY		SEIIAAILIG
DPTVRWGDKS		YNLISFSNGV		FGCNCDHAPF		DAMIMVNISY		YVDEKIFQNE
GRWKGSEKVR		DIPLPEELIF		IVDEKVLNDI		NQAKAQYLRE		ASDLQIAAYA
FTSFGKKLTK		NKMLHPDTFI		QLALQLAYYR		LHGHPGCCYE		TAMTRHFYHG
RTETMRSCTV		EAVRWCQSMQ		DPSVNLRERQ		QKMLQAFAKH		NKMMKDCSAG
KGFDRHLLGL		LLIAKEEGLP		VPELFTDPLF		SKSGGGGNFV		LSTSLVGYLR
VQGVVVPMVH		NGYGFFYHIR		DDRFVVACSA		WKSCPETDAE		KLVQLTFCAF
HDMIQLMNST		HL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7