CSDE1

CSDE1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WFQ, 1X65, 2YTV, 2YTX, 2YTY
Ідентифікатори
Символи	CSDE1, D1S155E, UNR, cold shock domain containing E1
Зовнішні ІД	OMIM: 191510 MGI: 92356 HomoloGene: 5179 GeneCards: CSDE1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• CRD-mediated mRNA stability complex; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • клітинна мембрана; • комплекс Ґольджі; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• male gonad development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7812
	229663
	ENSG00000009307
	ENSMUSG00000068823
	O75534
	Q91W50
NM_007158; NM_001007553; NM_001130523; NM_001242891; NM_001242892;
	NM_001242893
	NM_001161854; NM_144901; NM_001310693
NP_001007554; NP_001123995; NP_001229820; NP_001229821; NP_001229822;
	NP_009089
	NP_001155326; NP_001297622; NP_659150
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CSDE1 (англ. Cold shock domain containing E1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 88 885^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFDPNLLHN	NGHNGYPNGT	SAALRETGVI	EKLLTSYGFI	QCSERQARLF
FHCSQYNGNL	QDLKVGDDVE	FEVSSDRRTG	KPIAVKLVKI	KQEILPEERM
NGQVVCAVPH	NLESKSPAAP	GQSPTGSVCY	ERNGEVFYLT	YTPEDVEGNV
QLETGDKINF	VIDNNKHTGA	VSARNIMLLK	KKQARCQGVV	CAMKEAFGFI
ERGDVVKEIF	FHYSEFKGDL	ETLQPGDDVE	FTIKDRNGKE	VATDVRLLPQ
GTVIFEDISI	EHFEGTVTKV	IPKVPSKNQN	DPLPGRIKVD	FVIPKELPFG
DKDTKSKVTL	LEGDHVRFNI	STDRRDKLER	ATNIEVLSNT	FQFTNEAREM
GVIAAMRDGF	GFIKCVDRDV	RMFFHFSEIL	DGNQLHIADE	VEFTVVPDML
SAQRNHAIRI	KKLPKGTVSF	HSHSDHRFLG	TVEKEATFSN	PKTTSPNKGK
EKEAEDGIIA	YDDCGVKLTI	AFQAKDVEGS	TSPQIGDKVE	FSISDKQRPG
QQVATCVRLL	GRNSNSKRLL	GYVATLKDNF	GFIETANHDK	EIFFHYSEFS
GDVDSLELGD	MVEYSLSKGK	GNKVSAEKVN	KTHSVNGITE	EADPTIYSGK
VIRPLRSVDP	TQTEYQGMIE	IVEEGDMKGE	VYPFGIVGMA	NKGDCLQKGE
SVKFQLCVLG	QNAQTMAYNI	TPLRRATVEC	VKDQFGFINY	EVGDSKKLFF
HVKEVQDGIE	LQAGDEVEFS	VILNQRTGKC	SACNVWRVCE	GPKAVAAPRP
DRLVNRLKNI	TLDDASAPRL	MVLRQPRGPD	NSMGFGAERK	IRQAGVID

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Boussadia O., Jacquemin-Sablon H., Dautry F. (1993). Exon skipping in the expression of the gene immediately upstream of N-ras (unr/NRU). Biochim. Biophys. Acta. 1172: 64—72. PMID 8439573 DOI:10.1016/0167-4781(93)90270-N
Hunt S.L., Hsuan J.J., Totty N., Jackson R.J. (1999). unr, a cellular cytoplasmic RNA-binding protein with five cold-shock domains, is required for internal initiation of translation of human rhinovirus RNA. Genes Dev. 13: 437—448. PMID 10049359 DOI:10.1101/gad.13.4.437
Patel G.P., Ma S., Bag J. (2005). The autoregulatory translational control element of poly(A)-binding protein mRNA forms a heteromeric ribonucleoprotein complex. Nucleic Acids Res. 33: 7074—7089. PMID 16356927 DOI:10.1093/nar/gki1014
Nicolaiew N., Triqueneaux G., Dautry F. (1991). Organization of the human N-ras locus: characterization of a gene located immediately upstream of N-ras. Oncogene. 6: 721—730. PMID 2052355