CSPG5

CSPG5
Ідентифікатори
Символи	CSPG5, NGC, chondroitin sulfate proteoglycan 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606775 MGI: 1352747 HomoloGene: 4795 GeneCards: CSPG5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • growth factor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • lysosomal lumen • ендоплазматичний ретикулум • Golgi lumen • Golgi-associated vesicle membrane • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane Біологічний процес • диференціація клітин • chondroitin sulfate biosynthetic process • modulation of chemical synaptic transmission • intracellular transport • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • chondroitin sulfate catabolic process • regulation of growth • dermatan sulfate biosynthetic process • regulation of signaling receptor activity • trans-synaptic signaling, modulating synaptic transmission • regulation of synaptic vesicle exocytosis • cytoskeleton organization • glial cell projection elongation • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10675	29873
Ensembl	ENSG00000114646	ENSMUSG00000032482
UniProt	O95196	Q71M36
RefSeq (мРНК)	NM_006574 NM_001206942 NM_001206943 NM_001206944 NM_001206945	NM_001166273 NM_013884
RefSeq (білок)	NP_001193871 NP_001193872 NP_001193873 NP_001193874 NP_006565	NP_001159745 NP_038912
Локус (UCSC)	Хр. 3: 47.56 – 47.58 Mb	Хр. 9: 110.07 – 110.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CSPG5 (англ. Chondroitin sulfate proteoglycan 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 60 016.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRAGGGGPG		RGPPPLLLFL		GAALVLASGA		VPAREAGSAV		EAEELVKGSP
AWEPPANDTR		EEAGPPAAGE		DEASWTAPGG		ELAGPEEVLQ		ESAAVTGTAW
LEADSPGLGG		VTAEAGSGDA		QALPATLQAP		HEVLGQSIMP		PAIPEATEAS
GPPSPTPGDK		LSPASELPKE		SPLEVWLNLG		GSTPDPQGPE		LTYPFQGTLE
PQPASDIIDI		DYFEGLDGEG		RGADLGSFPG		SPGTSENHPD		TEGETPSWSL
LDLYDDFTPF		DESDFYPTTS		FYDDLDEEEE		EEEDDKDAVG		GGDLEDENEL
LVPTGKPGLG		PGTGQPTSRW		HAVPPQHTLG		SVPGSSIALR		PRPGEPGRDL
ASSENGTECR		SGFVRHNGSC		RSVCDLFPSY		CHNGGQCYLV		ENIGAFCRCN
TQDYIWHKGM		RCESIITDFQ		VMCVAVGSAA		LVLLLLFMMT		VFFAKKLYLL
KTENTKLRRT		NKFRTPSELH		NDNFSLSTIA		EGSHPNVRKL		CNTPRTSSPH
ARALAHYDNV		ICQDDPSAPH		KIQEVLKSCL		KEEESFNIQN		SMSPKLEGGK
GDQADLDVNC		LQNNLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція росту, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Hassel B., Schreff M., Stuebe E.-M., Blaich U., Schumacher S. (2003). CALEB/NGC interacts with the Golgi-associated protein PIST. J. Biol. Chem. 278: 40136—40143. PMID 12885772 DOI:10.1074/jbc.M305577200
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 3