CST5

CST5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RN7, 1ROA
Ідентифікатори
Символи	CST5, cystatin D
Зовнішні ІД	OMIM: 123858 MGI: 1930004 HomoloGene: 55615 GeneCards: CST5
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • protease binding Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of peptidase activity • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • negative regulation of endopeptidase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1473	58214
Ensembl	ENSG00000170367	ENSMUSG00000033156
UniProt	P28325	Q9JM84
RefSeq (мРНК)	NM_001900	NM_021405
RefSeq (білок)	NP_001891	NP_067380
Локус (UCSC)	Хр. 20: 23.88 – 23.88 Mb	Хр. 2: 149.25 – 149.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CST5 (англ. Cystatin D) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 080.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMWPMHTPLL		LLTALMVAVA		GSASAQSRTL		AGGIHATDLN		DKSVQCALDF
AISEYNKVIN		KDEYYSRPLQ		VMAAYQQIVG		GVNYYFNVKF		GRTTCTKSQP
NLDNCPFNDQ		PKLKEEEFCS		FQINEVPWED		KISILNYKCR		KV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Alvarez-Fernandez M., Liang Y.H., Abrahamson M., Su X.D. (2005). Crystal structure of human cystatin D, a cysteine peptidase inhibitor with restricted inhibition profile. J. Biol. Chem. 280: 18221—18228. PMID 15728581 DOI:10.1074/jbc.M411914200
• Balbin M., Freije J.P., Abrahamson M., Velasco G., Lopez-Otin C. (1993). A sequence variation in the human cystatin D gene resulting in an amino acid (Cys/Arg) polymorphism at the protein level. Hum. Genet. 90: 668—669. PMID 8444475 DOI:10.1007/BF00202491

Див. також

• Хромосома 20