CTCFL

CTCFL
Ідентифікатори
Символи	CTCFL, BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, CCCTC-binding factor like
Зовнішні ІД	OMIM: 607022 MGI: 3652571 HomoloGene: 46476 GeneCards: CTCFL
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • regulation of gene expression by genetic imprinting • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of histone H3-K4 methylation • DNA methylation involved in gamete generation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • клітинний цикл • histone methylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140690	664799
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000070495
UniProt	Q8NI51	A2APF3
RefSeq (мРНК)	NM_001269040 NM_001269041 NM_001269042 NM_001269043 NM_001269044 NM_001269045 NM_001269046 NM_001269047 NM_001269048 NM_001269049 NM_001269050 NM_001269051 NM_001269052 NM_001269054 NM_001269055 NM_080618 NM_001386993 NM_001386994 NM_001386995 NM_001386996 NM_001386997	NM_001081387 NM_001355185
RefSeq (білок)	NP_001255969 NP_001255970 NP_001255971 NP_001255972 NP_001255973 NP_001255974 NP_001255975 NP_001255976 NP_001255977 NP_001255978 NP_001255979 NP_001255980 NP_001255981 NP_001255983 NP_001255984 NP_542185	NP_001074856 NP_001342114
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 2: 172.94 – 172.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTCFL (англ. CCCTC-binding factor like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 75 747.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAATEISVLS		EQFTKIKELE		LMPEKGLKEE		EKDGVCREKD		HRSPSELEAE
RTSGAFQDSV		LEEEVELVLA		PSEESEKYIL		TLQTVHFTSE		AVELQDMSLL
SIQQQEGVQV		VVQQPGPGLL		WLEEGPRQSL		QQCVAISIQQ		ELYSPQEMEV
LQFHALEENV		MVASEDSKLA		VSLAETTGLI		KLEEEQEKNQ		LLAERTKEQL
FFVETMSGDE		RSDEIVLTVS		NSNVEEQEDQ		PTAGQADAEK		AKSTKNQRKT
KGAKGTFHCD		VCMFTSSRMS		SFNRHMKTHT		SEKPHLCHLC		LKTFRTVTLL
RNHVNTHTGT		RPYKCNDCNM		AFVTSGELVR		HRRYKHTHEK		PFKCSMCKYA
SVEASKLKRH		VRSHTGERPF		QCCQCSYASR		DTYKLKRHMR		THSGEKPYEC
HICHTRFTQS		GTMKIHILQK		HGENVPKYQC		PHCATIIARK		SDLRVHMRNL
HAYSAAELKC		RYCSAVFHER		YALIQHQKTH		KNEKRFKCKH		CSYACKQERH
MTAHIRTHTG		EKPFTCLSCN		KCFRQKQLLN		AHFRKYHDAN		FIPTVYKCSK
CGKGFSRWIN		LHRHSEKCGS		GEAKSAASGK		GRRTRKRKQT		ILKEATKGQK
EAAKGWKEAA		NGDEAAAEEA		STTKGEQFPG		EMFPVACRET		TARVKEEVDE
GVTCEMLLNT		MDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Jelinic P., Stehle J.-C., Shaw P. (2006). The testis-specific factor CTCFL cooperates with the protein methyltransferase PRMT7 in H19 imprinting control region methylation. PLoS Biol. 4: E355—E355. PMID 17048991 DOI:10.1371/journal.pbio.0040355
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer. Semin. Cancer Biol. 12: 399—414. PMID 12191639 DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3

Див. також

• Хромосома 20