CTDP1

CTDP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1J2X, 1ONV, 2K7L
Ідентифікатори
Символи	CTDP1, CCFDN, FCP1, CTD phosphatase subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604927 MGI: 1926953 HomoloGene: 31254 GeneCards: CTDP1
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital cataracts, facial dysmorphism, and neuropathy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • TFIIF-class transcription factor complex binding; • Tat protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • центросома; • spindle pole; • RNA polymerase II, holoenzyme; • веретено поділу; • центр організації мікротрубочок; • midbody; • spindle midzone; • цитоскелет; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • GO:0009327 protein-containing complex; • actin cytoskeleton; • nuclear speck;
Біологічний процес	• transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • exit from mitosis; • transcription by RNA polymerase II; • поділ клітини; • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development; • dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; • клітинний цикл; • positive regulation by host of viral transcription; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9150
	67655
	ENSG00000282752; ENSG00000060069
	ENSMUSG00000033323
	Q9Y5B0
	Q7TSG2
	NM_001202504; NM_004715; NM_048368; NM_001318511
	NM_026295
	NP_001189433; NP_001305440; NP_004706; NP_430255
	NP_080571
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CTDP1 (англ. CTD phosphatase subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 961 амінокислот, а молекулярна маса — 104 399^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVPAAGRVP	AEGAPTAAVA	EVRCPGPAPL	RLLEWRVAAG	AAVRIGSVLA
VFEAAASAQS	SGASQSRVAS	GGCVRPARPE	RRLRSERAGV	VRELCAQPGQ
VVAPGAVLVR	LEGCSHPVVM	KGLCAECGQD	LTQLQSKNGK	QQVPLSTATV
SMVHSVPELM	VSSEQAEQLG	REDQQRLHRN	RKLVLMVDLD	QTLIHTTEQH
CQQMSNKGIF	HFQLGRGEPM	LHTRLRPHCK	DFLEKIAKLY	ELHVFTFGSR
LYAHTIAGFL	DPEKKLFSHR	ILSRDECIDP	FSKTGNLRNL	FPCGDSMVCI
IDDREDVWKF	APNLITVKKY	VYFQGTGDMN	APPGSRESQT	RKKVNHSRGT
EVSEPSPPVR	DPEGVTQAPG	VEPSNGLEKP	ARELNGSEAA	TPRDSPRPGK
PDERDIWPPA	QAPTSSQELA	GAPEPQGSCA	QGGRVAPGQR	PAQGATGTDL
DFDLSSDSES	SSESEGTKSS	SSASDGESEG	KRGRQKPKAA	PEGAGALAQG
SSLEPGRPAA	PSLPGEAEPG	AHAPDKEPEL	GGQEEGERDG	LCGLGNGCAD
RKEAETESQN	SELSGVTAGE	SLDQSMEEEE	EEDTDEDDHL	IYLEEILVRV
HTDYYAKYDR	YLNKEIEEAP	DIRKIVPELK	SKVLADVAII	FSGLHPTNFP
IEKTREHYHA	TALGAKILTR	LVLSPDAPDR	ATHLIAARAG	TEKVLQAQEC
GHLHVVNPDW	LWSCLERWDK	VEEQLFPLRD	DHTKAQRENS	PAAFPDREGV
PPTALFHPMP	VLPKAQPGPE	VRIYDSNTGK	LIRTGARGPP	APSSSLPIRQ
EPSSFRAVPP	PQPQMFGEEL	PDAQDGEQPG	PSRRKRQPSM	SETMPLYTLC
KEDLESMDKE	VDDILGEGSD	DSDSEKRRPE	EQEEEPQPRK	PGTRRERTLG
APASSERSAA	GGRGPRGHKR	KLNEEDAASE	SSRESSNEDE	GSSSEADEMA
KALEAELNDL	M

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Friedl E.M., Lane W.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (2003). The C-terminal domain phosphatase and transcription elongation activities of FCP1 are regulated by phosphorylation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 2328—2333. PMID 12591939 DOI:10.1073/pnas.2628049100
Visconti R., Palazzo L., Della Monica R., Grieco D. (2012). Fcp1-dependent dephosphorylation is required for M-phase-promoting factor inactivation at mitosis exit. Nat. Commun. 3: 894—894. PMID 22692537 DOI:10.1038/ncomms1886
Kamada K., Roeder R.G., Burley S.K. (2003). Molecular mechanism of recruitment of TFIIF-associating RNA polymerase C-terminal domain phosphatase (FCP1) by transcription factor IIF. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 2296—2299. PMID 12591941 DOI:10.1073/pnas.262798199