CTDSP1

CTDSP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1T9Z, 1TA0, 2GHQ, 2GHT, 3L0B, 3L0C, 3L0Y, 3PGL, 4YGY, 4YH1
Ідентифікатори
Символи	CTDSP1, NIF3, NLI-IF, NLIIF, SCP1, CTD small phosphatase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605323 MGI: 2654470 HomoloGene: 100834 GeneCards: CTDSP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of neurogenesis • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58190	227292
Ensembl	ENSG00000144579	ENSMUSG00000026176
UniProt	Q9GZU7	P58466
RefSeq (мРНК)	NM_001206878 NM_001206879 NM_021198 NM_182642	NM_153088
RefSeq (білок)	NP_001193807 NP_067021 NP_872580	NP_694728
Локус (UCSC)	Хр. 2: 218.4 – 218.41 Mb	Хр. 1: 74.43 – 74.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTDSP1 (англ. CTD small phosphatase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 203.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSSAVITQI		SKEEARGPLR		GKGDQKSAAS		QKPRSRGILH		SLFCCVCRDD
GEALPAHSGA		PLLVEENGAI		PKQTPVQYLL		PEAKAQDSDK		ICVVIDLDET
LVHSSFKPVN		NADFIIPVEI		DGVVHQVYVL		KRPHVDEFLQ		RMGELFECVL
FTASLAKYAD		PVADLLDKWG		AFRARLFRES		CVFHRGNYVK		DLSRLGRDLR
RVLILDNSPA		SYVFHPDNAV		PVASWFDNMS		DTELHDLLPF		FEQLSRVDDV
YSVLRQPRPG		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Marquet S., Lepage P., Hudson T.J., Musser J.M., Schurr E. (2000). Complete nucleotide sequence and genomic structure of the human NRAMP1 gene region on chromosome region 2q35. Mamm. Genome. 11: 755—762. PMID 10967134 DOI:10.1007/s003350010151
• Yeo M., Lin P.S., Dahmus M.E., Gill G.N. (2003). A novel RNA polymerase II C-terminal domain phosphatase that preferentially dephosphorylates serine 5. J. Biol. Chem. 278: 26078—26085. PMID 12721286 DOI:10.1074/jbc.M301791200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kamenski T., Heilmeier S., Meinhart A., Cramer P. (2004). Structure and mechanism of RNA polymerase II CTD phosphatases. Mol. Cell. 15: 399—407. PMID 15304220 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.035

Див. також

• Хромосома 2