CTHRC1

CTHRC1
Ідентифікатори
Символи	CTHRC1, collagen triple helix repeat containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610635 MGI: 1915838 HomoloGene: 16320 GeneCards: CTHRC1
Онтологія гена Молекулярна функція • Wnt-protein binding • GO:0005110 frizzled binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • цитоплазма • колаген • міжклітинний простір • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of osteoblast proliferation • positive regulation of protein binding • positive regulation of osteoblast differentiation • cell migration • inner ear receptor cell stereocilium organization • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • cochlea morphogenesis • establishment of planar polarity involved in neural tube closure • ossification involved in bone remodeling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	115908	68588
Ensembl	ENSG00000164932	ENSMUSG00000054196
UniProt	Q96CG8	Q9D1D6
RefSeq (мРНК)	NM_001256099 NM_138455	NM_026778 NM_001364812 NM_001364813
RefSeq (білок)	NP_001243028 NP_612464	NP_081054 NP_001351741 NP_001351742
Локус (UCSC)	Хр. 8: 103.37 – 103.38 Mb	Хр. 15: 38.94 – 38.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTHRC1 (англ. Collagen triple helix repeat containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 224.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPQGPAASP		QRLRGLLLLL		LLQLPAPSSA		SEIPKGKQKA		QLRQREVVDL
YNGMCLQGPA		GVPGRDGSPG		ANGIPGTPGI		PGRDGFKGEK		GECLRESFEE
SWTPNYKQCS		WSSLNYGIDL		GKIAECTFTK		MRSNSALRVL		FSGSLRLKCR
NACCQRWYFT		FNGAECSGPL		PIEAIIYLDQ		GSPEMNSTIN		IHRTSSVEGL
CEGIGAGLVD		VAIWVGTCSD		YPKGDASTGW		NSVSRIIIEE		LPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 8