CXCL12

CXCL12
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A15, 1QG7, 1SDF, 1VMC, 2J7Z, 2K01, 2K03, 2K04, 2K05, 2KEC, 2KED, 2KEE, 2KOL, 2NWG, 2SDF, 3GV3, 3HP3, 4LMQ, 4UAI, 2N55
Ідентифікатори
Символи	CXCL12, IRH, PBSF, SCYB12, SDF1, TLSF, TPAR1, C-X-C motif chemokine ligand 12
Зовнішні ІД	OMIM: 600835 MGI: 103556 HomoloGene: 128606 GeneCards: CXCL12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine receptor binding; • cytokine activity; • chemokine activity; • CXCR chemokine receptor binding; • chemoattractant activity; • growth factor activity; • signaling receptor binding; • integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • extracellular region; • екзосома; • external side of plasma membrane; • міжклітинний простір; • цитоплазма; • клітинне ядро; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• negative regulation of leukocyte tethering or rolling; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • regulation of calcium ion transport; • response to hypoxia; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • positive regulation of cell migration; • chemokine-mediated signaling pathway; • adult locomotory behavior; • response to mechanical stimulus; • response to peptide hormone; • positive regulation of monocyte chemotaxis; • cellular calcium ion homeostasis; • response to virus; • neuron migration; • response to heat; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • positive regulation of axon extension involved in axon guidance; • кровообіг; • telencephalon cell migration; • хемотаксис; • regulation of actin polymerization or depolymerization; • positive regulation of calcium ion import; • brain development; • адгезія клітин; • positive regulation of dopamine secretion; • animal organ regeneration; • positive regulation of neuron differentiation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of cell population proliferation; • cell chemotaxis; • negative regulation of leukocyte apoptotic process; • response to radiation; • positive regulation of T cell migration; • positive regulation of cell adhesion; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive chemotaxis; • induction of positive chemotaxis; • defense response; • response to ultrasound; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • T cell chemotaxis; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • regulation of signaling receptor activity; • axon guidance; • GO:0022415 viral process; • integrin activation; • chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway; • cellular response to chemokine; • negative regulation of dendritic cell apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6387
	20315
	ENSG00000107562
	ENSMUSG00000061353
	P48061
	P40224
	NM_199168; NM_000609; NM_001033886; NM_001178134; NM_001277990
	NM_001012477; NM_013655; NM_021704
	NP_000600; NP_001029058; NP_001171605; NP_001264919; NP_954637
	NP_001012495; NP_038683; NP_068350
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CXCL12 або SDF-1(англ. C-X-C motif chemokine ligand 12) – білок, який кодується геном CXCL12, розташованим у людей на довгому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 93 амінокислот, а молекулярна маса — 10 666^[4]. Хемокін підродини CXC, взаємодіє з рецепторами CXCR4 і CXCR7 та відіграє важливу роль в ембріональному розвитку і гематопоезі.^[5] CXCL12 виступає не тільки як хемоатрактант: у деяких випадках він може стимулювати проліферацію клітин і сприяти їх виживанню.^[6]

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAKVVVVLV		LVLTALCLSD		GKPVSLSYRC		PCRFFESHVA		RANVKHLKIL
NTPNCALQIV		ARLKNNNRQV		CIDPKLKWIQ		EYLEKALNKR		FKM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Функції

CXCL12 виконує безліч функцій як в дорослому організмі, так і в ході ембріонального розвитку. У першу чергу, CXCL12 є хемоаттрактантом для клітин, які мають його рецептори на мембрані, наприклад для B-лімфоцитів і гемопоетичних стовбурових клітин. Клітини строми кісткового мозку синтезують CXCL12, який забезпечує локалізацію гемопоетичних клітин-попередників у їх клітинних нішах і не дає їм завчасно покинути кістковий мозок. В ембріональному розвитку CXCL12 керує міграцією різних типів клітин і відіграє важливу роль у формуванні органів.^[7]

CXCL12 виступає як фактор росту для B-клітин і стимулює їх проліферацію. Крім того, CXCL12 може захищати злоякісні В-клітини від апоптозу при хронічному лімфоцитарному лейкозі.^[8]

Див. також

Хромосома 10

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10672 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018. [Архівовано 2018-02-13 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P48061 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
↑ Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. — Т. 145, вип. 1—2. — С. 47—54. — DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.009. — PMID 22698183.
↑ Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. — Т. 7, вип. 374. — С. 174—179. — PMID 16626895.
↑ Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. — Т. 23, вип. 3. — С. 333—340. — DOI:10.1016/j.semcdb.2012.03.009. — PMID 22414535.
↑ Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. — Т. 96, вип. 8. — С. 2655—2663. — PMID 11023495.^{[недоступне посилання з листопадаа 2019]}

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Veldkamp C.T., Peterson F.C., Pelzek A.J., Volkman B.F. (2005). The monomer-dimer equilibrium of stromal cell-derived factor-1 (CXCL 12) is altered by pH, phosphate, sulfate, and heparin. Protein Sci. 14: 1071—1081. PMID 15741341 DOI:10.1110/ps.041219505
Veldkamp C.T., Seibert C., Peterson F.C., Sakmar T.P., Volkman B.F. (2006). Recognition of a CXCR4 sulfotyrosine by the chemokine stromal cell-derived factor-1alpha (SDF-1alpha/CXCL12). J. Mol. Biol. 359: 1400—1409. PMID 16725153 DOI:10.1016/j.jmb.2006.04.052
Gozansky E.K., Louis J.M., Caffrey M., Clore G.M. (2005). Mapping the binding of the N-terminal extracellular tail of the CXCR4 receptor to stromal cell-derived factor-1alpha. J. Mol. Biol. 345: 651—658. PMID 15588815 DOI:10.1016/j.jmb.2004.11.003
Murphy J.W., Yuan H., Kong Y., Xiong Y., Lolis E.J. (2010). Heterologous quaternary structure of CXCL12 and its relationship to the CC chemokine family. Proteins. 78: 1331—1337. PMID 20077567 DOI:10.1002/prot.22666

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10672 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018. [Архівовано 2018-02-13 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P48061 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.

[Rankin-5] Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. — Т. 145, вип. 1—2. — С. 47—54. — DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.009. — PMID 22698183.

[Yu-6] Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. — Т. 7, вип. 374. — С. 174—179. — PMID 16626895.

[Lewellis-7] Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. — Т. 23, вип. 3. — С. 333—340. — DOI:10.1016/j.semcdb.2012.03.009. — PMID 22414535.

[Burger-8] Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. — Т. 96, вип. 8. — С. 2655—2663. — PMID 11023495.^{[недоступне посилання з листопадаа 2019]}

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]