CYLD

CYLD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IXD, 1WHL, 1WHM, 2VHF
Ідентифікатори
Символи	CYLD, BRSS, CDMT, CYLD1, CYLDI, EAC, MFT, MFT1, SBS, TEM, USPL2, CYLD lysine 63 deubiquitinase
Зовнішні ІД	OMIM: 605018 MGI: 1921506 HomoloGene: 9069 GeneCards: CYLD
Пов'язані генетичні захворювання
	multiple familial trichoepithelioma, familial cylindromatosis
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • proline-rich region binding; • hydrolase activity; • protein kinase binding; • Lys63-specific deubiquitinase activity; • Lys48-specific deubiquitinase activity; • structural constituent of ribosome;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • центросома; • cell projection; • мембрана; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • веретено поділу; • центр організації мікротрубочок; • midbody; • perinuclear region of cytoplasm; • cytoplasmic microtubule; • цитоскелет; • мікротрубочка; • ciliary basal body; • ciliary tip;
Біологічний процес	• regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of microtubule cytoskeleton organization; • Wnt signaling pathway; • протеоліз; • protein K63-linked deubiquitination; • regulation of mitotic cell cycle; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • клітинний цикл; • negative regulation of type I interferon production; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • процес імунної системи; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • protein deubiquitination; • CD4-positive or CD8-positive, alpha-beta T cell lineage commitment; • regulation of protein binding; • вроджений імунітет; • regulation of B cell differentiation; • negative regulation of T cell differentiation; • positive regulation of T cell differentiation; • homeostasis of number of cells; • positive regulation of T cell receptor signaling pathway; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • protein K48-linked deubiquitination; • ripoptosome assembly involved in necroptotic process; • regulation of cilium assembly; • positive regulation of protein localization; • protein linear deubiquitination; • cytoplasmic translation; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • negative regulation of JNK cascade; • negative regulation of p38MAPK cascade; • regulation of inflammatory response; • regulation of necroptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1540
	74256
	ENSG00000083799
	ENSMUSG00000036712
	Q9NQC7
	Q80TQ2
	NM_001042355; NM_001042412; NM_015247
	NM_001128169; NM_001128170; NM_001128171; NM_001276279; NM_173369
NP_001035814; NP_001035877; NP_056062; NP_001365672; NP_001365673;
	NP_001365674; NP_001365675; NP_001365676; NP_001365677; NP_001365678; NP_001365679; NP_001365680; NP_001365681; NP_001365682; NP_001365683; NP_001365684; NP_001035814.1; NP_001035877.1
	NP_001121642; NP_001121643; NP_001263208; NP_775545
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CYLD (англ. CYLD lysine 63 deubiquitinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 107 316^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSGLWSQEK	VTSPYWEERI	FYLLLQECSV	TDKQTQKLLK	VPKGSIGQYI
QDRSVGHSRI	PSAKGKKNQI	GLKILEQPHA	VLFVDEKDVV	EINEKFTELL
LAITNCEERF	SLFKNRNRLS	KGLQIDVGCP	VKVQLRSGEE	KFPGVVRFRG
PLLAERTVSG	IFFGVELLEE	GRGQGFTDGV	YQGKQLFQCD	EDCGVFVALD
KLELIEDDDT	ALESDYAGPG	DTMQVELPPL	EINSRVSLKV	GETIESGTVI
FCDVLPGKES	LGYFVGVDMD	NPIGNWDGRF	DGVQLCSFAC	VESTILLHIN
DIIPALSESV	TQERRPPKLA	FMSRGVGDKG	SSSHNKPKAT	GSTSDPGNRN
RSELFYTLNG	SSVDSQPQSK	SKNTWYIDEV	AEDPAKSLTE	ISTDFDRSSP
PLQPPPVNSL	TTENRFHSLP	FSLTKMPNTN	GSIGHSPLSL	SAQSVMEELN
TAPVQESPPL	AMPPGNSHGL	EVGSLAEVKE	NPPFYGVIRW	IGQPPGLNEV
LAGLELEDEC	AGCTDGTFRG	TRYFTCALKK	ALFVKLKSCR	PDSRFASLQP
VSNQIERCNS	LAFGGYLSEV	VEENTPPKME	KEGLEIMIGK	KKGIQGHYNS
CYLDSTLFCL	FAFSSVLDTV	LLRPKEKNDV	EYYSETQELL	RTEIVNPLRI
YGYVCATKIM	KLRKILEKVE	AASGFTSEEK	DPEEFLNILF	HHILRVEPLL
KIRSAGQKVQ	DCYFYQIFME	KNEKVGVPTI	QQLLEWSFIN	SNLKFAEAPS
CLIIQMPRFG	KDFKLFKKIF	PSLELNITDL	LEDTPRQCRI	CGGLAMYECR
ECYDDPDISA	GKIKQFCKTC	NTQVHLHPKR	LNHKYNPVSL	PKDLPDWDWR
HGCIPCQNME	LFAVLCIETS	HYVAFVKYGK	DDSAWLFFDS	MADRDGGQNG
FNIPQVTPCP	EVGEYLKMSL	EDLHSLDSRR	IQGCARRLLC	DAYMCMYQSP
TMSLYK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, клітинний цикл, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Brummelkamp T.R., Nijman S.M.B., Dirac A.M.G., Bernards R. (2003). Loss of the cylindromatosis tumour suppressor inhibits apoptosis by activating NF-kappaB. Nature. 424: 797—801. PMID 12917690 doi:10.1038/nature01811
Reiley W., Zhang M., Wu X., Granger E., Sun S.C. (2005). Regulation of the deubiquitinating enzyme CYLD by IkappaB kinase gamma-dependent phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 25: 3886—3895. PMID 15870263 doi:10.1128/MCB.25.10.3886-3895.2005
Wickstrom S.A., Masoumi K.C., Khochbin S., Fassler R., Massoumi R. (2010). CYLD negatively regulates cell-cycle progression by inactivating HDAC6 and increasing the levels of acetylated tubulin. EMBO J. 29: 131—144. PMID 19893491 doi:10.1038/emboj.2009.317
Scheinfeld N., Hu G., Gill M., Austin C., Celebi J.T. (2003). Identification of a recurrent mutation in the CYLD gene in Brooke-Spiegler syndrome. Clin. Exp. Dermatol. 28: 539—541. PMID 12950348 doi:10.1046/j.1365-2230.2003.01344.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CYLD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2584 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NQC7 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CYLD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2584 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9NQC7 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]