DCP2

DCP2
Ідентифікатори
Символи	DCP2, NUDT20, decapping mRNA 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609844 MGI: 1917890 HomoloGene: 13968 GeneCards: DCP2
Онтологія гена Молекулярна функція • m7G(5')pppN diphosphatase activity • manganese ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters • RNA binding • hydrolase activity • 5'-3' exoribonuclease activity • telomerase RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • RISC • гіалоплазма • P-body • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • клітинне ядро • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • mRNA catabolic process • regulation of mRNA stability • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • histone mRNA catabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • regulation of telomerase RNA localization to Cajal body Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	167227	70640
Ensembl	ENSG00000172795	ENSMUSG00000024472
UniProt	Q8IU60	Q9CYC6
RefSeq (мРНК)	NM_001242377 NM_152624	NM_027490
RefSeq (білок)	NP_001229306 NP_689837	NP_081766
Локус (UCSC)	Хр. 5: 112.98 – 113.02 Mb	Хр. 18: 44.51 – 44.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCP2 (англ. Decapping mRNA 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 48 457.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METKRVEIPG		SVLDDFCSRF		ILHIPSEERD		NAIRVCFQIE		LAHWFYLDFY
MQNTPGLPQC		GIRDFAKAVF		SHCPFLLPQG		EDVEKVLDEW		KEYKMGVPTY
GAIILDETLE		NVLLVQGYLA		KSGWGFPKGK		VNKEEAPHDC		AAREVFEETG
FDIKDYICKD		DYIELRINDQ		LARLYIIPGI		PKDTKFNPKT		RREIRNIEWF
SIEKLPCHRN		DMTPKSKLGL		APNKFFMAIP		FIRPLRDWLS		RRFGDSSDSD
NGFSSTGSTP		AKPTVEKLSR		TKFRHSQQLF		PDGSPGDQWV		KHRQPLQQKP
YNNHSEMSDL		LKGKNQSMRG		NGRKQYQDSP		NQKKRTNGLQ		PAKQQNSLMK
CEKKLHPRKL		QDNFETDAVY		DLPSSSEDQL		LEHAEGQPVA		CNGHCKFPFS
SRAFLSFKFD		HNAIMKILDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 DOI:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
• Wang Z., Jiao X., Carr-Schmid A., Kiledjian M. (2002). The hDcp2 protein is a mammalian mRNA decapping enzyme. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12663—12668. PMID 12218187 DOI:10.1073/pnas.192445599
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities. Mol. Cell. 12: 675—687. PMID 14527413 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6
• Piccirillo C., Khanna R., Kiledjian M. (2003). Functional characterization of the mammalian mRNA decapping enzyme hDcp2. RNA. 9: 1138—1147. PMID 12923261 DOI:10.1261/rna.5690503
• Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004

Див. також

• Хромосома 5