DDRGK1

DDRGK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI9
Ідентифікатори
Символи	DDRGK1, C20orf116, UFBP1, dJ1187M17.3, DDRGK domain containing 1, SEMDSH
Зовнішні ІД	OMIM: 616177 MGI: 1924256 HomoloGene: 11400 GeneCards: DDRGK1
Пов'язані генетичні захворювання
гепатит C, spondyloepimetaphyseal dysplasia, Shohat type
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-like protein ligase binding Клітинна компонента • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB phosphorylation • regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • protein K69-linked ufmylation • response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of cell population proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of cell migration • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition • positive regulation of metallopeptidase activity • positive regulation of protein localization to endoplasmic reticulum • positive regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • cartilage development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	65992	77006
Ensembl	ENSG00000198171	ENSMUSG00000068290
UniProt	Q96HY6	Q80WW9
RefSeq (мРНК)	NM_023935	NM_029832
RefSeq (білок)	NP_076424	NP_084108
Локус (UCSC)	Хр. 20: 3.19 – 3.2 Mb	Хр. 2: 130.5 – 130.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDRGK1 (англ. DDRGK domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 611.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVAPVWYLVA		AALLVGFILF		LTRSRGRAAS		AGQEPLHNEE		LAGAGRVAQP
GPLEPEEPRA		GGRPRRRRDL		GSRLQAQRRA		QRVAWAEADE		NEEEAVILAQ
EEEGVEKPAE		THLSGKIGAK		KLRKLEEKQA		RKAQREAEEA		EREERKRLES
QREAEWKKEE		ERLRLEEEQK		EEEERKAREE		QAQREHEEYL		KLKEAFVVEE
EGVGETMTEE		QSQSFLTEFI		NYIKQSKVVL		LEDLASQVGL		RTQDTINRIQ
DLLAEGTITG		VIDDRGKFIY		ITPEELAAVA		NFIRQRGRVS		IAELAQASNS
LIAWGRESPA		QAPA

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu J., Lei G., Mei M., Tang Y., Li H. (2010). A novel C53/LZAP-interacting protein regulates stability of C53/LZAP and DDRGK domain-containing Protein 1 (DDRGK1) and modulates NF-kappaB signaling. J. Biol. Chem. 285: 15126—15136. PMID 20228063 DOI:10.1074/jbc.M110.110619
• Xi P., Ding D., Zhou J., Wang M., Cong Y.S. (2013). DDRGK1 regulates NF-kappaB activity by modulating IkappaBalpha stability. PLoS ONE. 8: E64231—E64231. PMID 23675531 DOI:10.1371/journal.pone.0064231

Див. також

• Хромосома 20