DDX39

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
DDX39
Ідентифікатори
Символи DDX39A, BAT1, BAT1L, DDX39, DDXL, URH49, DEAD-box helicase 39A, DExD-box helicase 39A
Зовнішні ІД MGI: 1915528 HomoloGene: 68487 GeneCards: DDX39A
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001204057
NM_005804
NM_138998
NM_197982
NM_001363116
NM_001363117
RefSeq (білок)
NP_005795
NP_932099
NP_001350045
NP_001350046
Локус (UCSC) Хр. 19: 14.41 – 14.42 Mb Хр. 8: 84.44 – 84.45 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DDX39 (англ. DExD-box helicase 39A) – білок, який кодується геном DDX39A, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 49 130[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFL
LKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVL
ATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGG
LSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKM
LEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFV
DDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCM
ALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGM
DIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILN
DVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR

Цей білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Sugiura T., Nagano Y., Noguchi Y. (2007). DDX39, upregulated in lung squamous cell cancer, displays RNA helicase activities and promotes cancer cell growth. Cancer Biol. Ther. 6: 957—964. PMID 17548965 DOI:10.4161/cbt.6.6.4192
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lischka P., Toth Z., Thomas M., Mueller R., Stamminger T. (2006). The UL69 transactivator protein of human cytomegalovirus interacts with DEXD/H-Box RNA helicase UAP56 to promote cytoplasmic accumulation of unspliced RNA. Mol. Cell. Biol. 26: 1631—1643. PMID 16478985 DOI:10.1128/MCB.26.5.1631-1643.2006
  • Sugiura T., Sakurai K., Nagano Y. (2007). Intracellular characterization of DDX39, a novel growth-associated RNA helicase. Exp. Cell Res. 313: 782—790. PMID 17196963 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.11.014
  • Wisskirchen C., Ludersdorfer T.H., Mueller D.A., Moritz E., Pavlovic J. (2011). Interferon-induced antiviral protein MxA interacts with the cellular RNA helicases UAP56 and URH49. J. Biol. Chem. 286: 34743—34751. PMID 21859714 DOI:10.1074/jbc.M111.251843

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17821 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 лютого 2017.
  4. UniProt, O00148 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]