DEFA4

DEFA4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZMM
Ідентифікатори
Символи	DEFA4, DEF4, HNP-4, HP-4, HP4, defensin alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 601157 MGI: 3711900 HomoloGene: 48059 GeneCards: DEFA4
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity Клітинна компонента • Golgi lumen • extracellular region • azurophil granule • міжклітинний простір • specific granule lumen Біологічний процес • defense response • defense response to bacterium • neutrophil degranulation • вроджений імунітет • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • T cell chemotaxis • antimicrobial humoral response • killing of cells of other organism • defense response to fungus • innate immune response in mucosa • antibacterial humoral response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • membrane disruption in other organism • cellular response to lipopolysaccharide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1669	100041688
Ensembl	ENSG00000164821 ENSG00000285318	ENSMUSG00000061845
UniProt	P12838	E9QLQ1
RefSeq (мРНК)	NM_001925	NM_001177481
RefSeq (білок)	NP_001916	NP_001170952
Локус (UCSC)	Хр. 8: 6.94 – 6.94 Mb	Хр. 8: 21.56 – 21.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DEFA4 (англ. Defensin alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 97 амінокислот, а молекулярна маса — 10 504.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRIIALLAAI		LLVALQVRAG		PLQARGDEAP		GQEQRGPEDQ		DISISFAWDK
SSALQVSGST		RGMVCSCRLV		FCRRTELRVG		NCLIGGVSFT		YCCTRVD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Секретований назовні.

Література

• Palfree R.G.E., Sadro L.C., Solomon S. (1993). The gene encoding the human corticostatin HP-4 precursor contains a recent 86-base duplication and is located on chromosome 8. Mol. Endocrinol. 7: 199—205. PMID 8469233 DOI:10.1210/mend.7.2.8469233
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005
• Wilde C.G., Griffith J.E., Marra M.N., Snable J.L., Scott R.W. (1989). Purification and characterization of human neutrophil peptide 4, a novel member of the defensin family. J. Biol. Chem. 264: 11200—11203. PMID 2500436

Див. також

• Хромосома 8