DET1

DET1
Ідентифікатори
Символи	DET1, de-etiolated homolog 1 (Arabidopsis), COP1 ubiquitin ligase partner, DET1 partner of COP1 E3 ubiquitin ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 608727 MGI: 1923625 HomoloGene: 9952 GeneCards: DET1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55070	76375
Ensembl	ENSG00000140543	ENSMUSG00000030610
UniProt	Q7L5Y6	Q9D0A0
RefSeq (мРНК)	NM_001144074 NM_017996 NM_001321594 NM_001321596	NM_029585
RefSeq (білок)	NP_001137546 NP_001308523 NP_001308525 NP_060466	NP_083861
Локус (UCSC)	Хр. 15: 88.49 – 88.55 Mb	Хр. 7: 78.47 – 78.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DET1 (англ. De-etiolated homolog 1 (Arabidopsis)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 550 амінокислот, а молекулярна маса — 63 848.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDHHVSTIKP		RRIQNQNVIH		RLERRRISSG		KAGTHWHQVR		VFHQNVFPNF
TVVNVEKPPC		FLRKFSPDGR		YFIAFSSDQT		SLEIYEYQGC		QAAEDLLQGY
EGEILSNGND		QRSVNIRGRL		FERFFVLLHI		TNVAANGEHL		NRECSLFTDD
CRCVIVGSAA		YLPDEPHPPF		FEVYRNSESV		TPNPRSPLED		YSLHIIDLHT
GRLCDTRTFK		CDKVVLSHNQ		GLYLYKNILA		ILSVQQQTIH		VFQVTPEGTF
IDVRTIGRFC		YEDDLLTVSA		VFPEVQRDSQ		TGMANPFRDP		FINSLKHRLL
VYLWRRAEQD		GSAMAKRRFF		QYFDQLRQLR		MWKMQLLDEN		HLFIKYTSED
VVTLRVTDPS		QASFFVVYNM		VTTEVIAVFE		NTSDELLELF		ENFCDLFRNA
TLHSEVQFPC		SASSNNFARQ		IQRRFKDTII		NAKYGGHTEA		VRRLLGQLPI
SAQSYSGSPY		LDLSLFSYDD		KWVSVMERPK		TCGDHPIRFY		ARDSGLLKFE
IQAGLLGRPI		NHTVRRLVAF		TFHPFEPFAI		SVQRTNAEYV		VNFHMRHCCT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15