DFFB

DFFB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IBX
Ідентифікатори
Символи	DFFB, DNA fragmentation factor, 40kDa, beta polypeptide (caspase-activated DNase), CAD, CPAN, DFF-40, DFF2, DFF40, DNA fragmentation factor subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 601883 MGI: 1196287 HomoloGene: 3241 GeneCards: DFFB
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • nuclease activity • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • deoxyribonuclease activity • protein domain specific binding • identical protein binding • disordered domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ядерце • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • apoptotic DNA fragmentation • apoptotic chromosome condensation • GO:0097285 апоптоз • DNA catabolic process • protein homooligomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1677	13368
Ensembl	ENSG00000169598	ENSMUSG00000029027
UniProt	O76075	O54788
RefSeq (мРНК)	NM_001004285 NM_001004286 NM_001282669 NM_004402 NM_001320132 NM_001320136	NM_007859
RefSeq (білок)	NP_001269598 NP_001307061 NP_001307065 NP_004393	NP_031885
Локус (UCSC)	Хр. 1: 3.86 – 3.89 Mb	Хр. 4: 154.05 – 154.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DFFB (англ. DNA fragmentation factor subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 39 110.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLQKPKSVKL		RALRSPRKFG		VAGRSCQEVL		RKGCLRFQLP		ERGSRLCLYE
DGTELTEDYF		PSVPDNAELV		LLTLGQAWQG		YVSDIRRFLS		AFHEPQVGLI
QAAQQLLCDE		QAPQRQRLLA		DLLHNVSQNI		AAETRAEDPP		WFEGLESRFQ
SKSGYLRYSC		ESRIRSYLRE		VSSYPSTVGA		EAQEEFLRVL		GSMCQRLRSM
QYNGSYFDRG		AKGGSRLCTP		EGWFSCQGPF		DMDSCLSRHS		INPYSNRESR
ILFSTWNLDH		IIEKKRTIIP		TLVEAIKEQD		GREVDWEYFY		GLLFTSENLK
LVHIVCHKKT		THKLNCDPSR		IYKPQTRLKR		KQPVRKRQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як апоптоз. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Ninios Y.P., Sekeri-Pataryas K.E., Sourlingas T.G. (2010). Histone H1 subtype preferences of DFF40 and possible nuclear localization of DFF40/45 in normal and trichostatin A-treated NB4 leukemic cells. Apoptosis. 15: 128—138. PMID 19882353 DOI:10.1007/s10495-009-0418-7

Див. також

• Хромосома 1