DHX36

DHX36
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2N16, 2N21
Ідентифікатори
Символи	DHX36, DDX36, G4R1, MLEL1, RHAU, DEAH-box helicase 36
Зовнішні ІД	OMIM: 612767 MGI: 1919412 HomoloGene: 6356 GeneCards: DHX36
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • DNA binding; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • GO:0008026 helicase activity; • G-quadruplex RNA binding; • histone deacetylase binding; • G-quadruplex DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • double-stranded RNA binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • telomerase RNA binding; • RNA binding; • single-stranded DNA binding; • magnesium ion binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • mRNA 3'-UTR binding; • GO:0004003 DNA helicase activity; • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity; • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding; • зв'язування з іоном металу; • mRNA 5'-UTR binding; • pre-miRNA binding;
Клітинна компонента	• хромосома; • теломера; • екзосома; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • мітохондрія; • cytoplasmic stress granule; • nuclear speck; • аксон; • дендрит (нейробіологія); • cell projection; • перикаріон;
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • осифікація; • response to exogenous dsRNA; • response to virus; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of telomere maintenance; • RNA secondary structure unwinding; • positive regulation of type I interferon production; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • telomerase RNA stabilization; • процес імунної системи; • positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production; • regulation of transcription by RNA polymerase III; • regulation of translation; • multicellular organism development; • Сперматогенез; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of translation; • диференціація клітин; • positive regulation of mRNA 3'-end processing; • DNA duplex unwinding; • cellular response to heat; • cellular response to UV; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • regulation of mRNA stability; • G-quadruplex DNA unwinding; • вроджений імунітет; • regulation of embryonic development; • defense response to virus; • positive regulation of cardioblast differentiation; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of dendritic spine morphogenesis; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • positive regulation of hematopoietic progenitor cell differentiation; • cellular response to arsenite ion; • positive regulation of telomere maintenance via telomere lengthening; • positive regulation of intracellular mRNA localization; • positive regulation of cytoplasmic translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	170506
	72162
	н/д
	ENSMUSG00000027770
	Q9H2U1
	Q8VHK9
	NM_020865; NM_001114397
	NM_028136
	NP_001107869; NP_065916
	NP_082412
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DHX36 (англ. DEAH-box helicase 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 008 амінокислот, а молекулярна маса — 114 760^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYDYHQNWG	RDGGPRSSGG	GYGGGPAGGH	GGNRGSGGGG	GGGGGGRGGR
GRHPGHLKGR	EIGMWYAKKQ	GQKNKEAERQ	ERAVVHMDER	REEQIVQLLN
SVQAKNDKES	EAQISWFAPE	DHGYGTEVST	KNTPCSENKL	DIQEKKLINQ
EKKMFRIRNR	SYIDRDSEYL	LQENEPDGTL	DQKLLEDLQK	KKNDLRYIEM
QHFREKLPSY	GMQKELVNLI	DNHQVTVISG	ETGCGKTTQV	TQFILDNYIE
RGKGSACRIV	CTQPRRISAI	SVAERVAAER	AESCGSGNST	GYQIRLQSRL
PRKQGSILYC	TTGIILQWLQ	SDPYLSSVSH	IVLDEIHERN	LQSDVLMTVV
KDLLNFRSDL	KVILMSATLN	AEKFSEYFGN	CPMIHIPGFT	FPVVEYLLED
VIEKIRYVPE	QKEHRSQFKR	GFMQGHVNRQ	EKEEKEAIYK	ERWPDYVREL
RRRYSASTVD	VIEMMEDDKV	DLNLIVALIR	YIVLEEEDGA	ILVFLPGWDN
ISTLHDLLMS	QVMFKSDKFL	IIPLHSLMPT	VNQTQVFKRT	PPGVRKIVIA
TNIAETSITI	DDVVYVIDGG	KIKETHFDTQ	NNISTMSAEW	VSKANAKQRK
GRAGRVQPGH	CYHLYNGLRA	SLLDDYQLPE	ILRTPLEELC	LQIKILRLGG
IAYFLSRLMD	PPSNEAVLLS	IRHLMELNAL	DKQEELTPLG	VHLARLPVEP
HIGKMILFGA	LFCCLDPVLT	IAASLSFKDP	FVIPLGKEKI	ADARRKELAK
DTRSDHLTVV	NAFEGWEEAR	RRGFRYEKDY	CWEYFLSSNT	LQMLHNMKGQ
FAEHLLGAGF	VSSRNPKDPE	SNINSDNEKI	IKAVICAGLY	PKVAKIRLNL
GKKRKMVKVY	TKTDGLVAVH	PKSVNVEQTD	FHYNWLIYHL	KMRTSSIYLY
DCTEVSPYCL	LFFGGDISIQ	KDNDQETIAV	DEWIVFQSPA	RIAHLVKELR
KELDILLQEK	IESPHPVDWN	DTKSRDCAVL	SAIIDLIKTQ	EKATPRNFPP
RFQDGYYS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Tran H., Schilling M., Wirbelauer C., Hess D., Nagamine Y. (2004). Facilitation of mRNA deadenylation and decay by the exosome-bound, DExH protein RHAU. Mol. Cell. 13: 101—111. PMID 14731398 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00481-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
Lattmann S., Giri B., Vaughn J.P., Akman S.A., Nagamine Y. (2010). Role of the amino terminal RHAU-specific motif in the recognition and resolution of guanine quadruplex-RNA by the DEAH-box RNA helicase RHAU. Nucleic Acids Res. 38: 6219—6233. PMID 20472641 DOI:10.1093/nar/gkq372
Sexton A.N., Collins K. (2011). The 5' guanosine tracts of human telomerase RNA are recognized by the G-quadruplex binding domain of the RNA helicase DHX36 and function to increase RNA accumulation. Mol. Cell. Biol. 31: 736—743. PMID 21149580 DOI:10.1128/MCB.01033-10
Fu J.-J., Li L.-Y., Lu G.-X. (2002). Molecular cloning and characterization of human DDX36 and mouse Ddx36 genes, new members of the DEAD/H box superfamily. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao. 34: 655—661. PMID 12198572

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14410 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H2U1 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14410 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H2U1 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

DHX36

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук