DIMT1

DIMT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZQ9
Ідентифікатори
Символи	DIMT1, DIM1, DIMT1L, HSA9761, HUSSY5, DIM1 dimethyladenosine transferase 1 homolog, DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, DIM1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor
Зовнішні ІД	OMIM: 612499 MGI: 1913504 HomoloGene: 7047 GeneCards: DIMT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • rRNA methyltransferase activity • 18S rRNA (adenine(1779)-N(6)/adenine(1780)-N(6))-dimethyltransferase activity • RNA binding • rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • мітохондріальний матрикс • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • rRNA processing • Метилювання • rRNA modification • rRNA methylation • positive regulation of rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27292	66254
Ensembl	ENSG00000086189	ENSMUSG00000021692
UniProt	Q9UNQ2	Q9D0D4
RefSeq (мРНК)	NM_014473 NM_001348076 NM_001348077	NM_025447
RefSeq (білок)	NP_055288 NP_001335005 NP_001335006	NP_079723
Локус (UCSC)	Хр. 5: 62.35 – 62.4 Mb	Хр. 13: 107.08 – 107.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DIMT1 (англ. DIM1 dimethyladenosine transferase 1 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 35 236.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKVKSGAIG		RRRGRQEQRR		ELKSAGGLMF		NTGIGQHILK		NPLIINSIID
KAALRPTDVV		LEVGPGTGNM		TVKLLEKAKK		VVACELDPRL		VAELHKRVQG
TPVASKLQVL		VGDVLKTDLP		FFDTCVANLP		YQISSPFVFK		LLLHRPFFRC
AILMFQREFA		LRLVAKPGDK		LYCRLSINTQ		LLARVDHLMK		VGKNNFRPPP
KVESSVVRIE		PKNPPPPINF		QEWDGLVRIT		FVRKNKTLSA		AFKSSAVQQL
LEKNYRIHCS		VHNIIIPEDF		SIADKIQQIL		TSTGFSDKRA		RSMDIDDFIR
LLHGFNAEGI		HFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5