DNA2

DNA2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5EAY
Ідентифікатори
Символи	DNA2, DNA2L, hDNA replication helicase/nuclease 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601810 MGI: 2443732 HomoloGene: 6124 GeneCards: DNA2
Пов'язані генетичні захворювання
mitochondrial DNA deletion syndrome with progressive myopathy, Seckel syndrome 8
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • 5'-flap endonuclease activity • GO:0004003 DNA helicase activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • GO:0043141 5'-3' DNA helicase activity • nuclease activity • endonuclease activity • site-specific endodeoxyribonuclease activity, specific for altered base • hydrolase activity • ATP binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • gamma DNA polymerase complex • mitochondrial nucleoid • клітинне ядро • мітохондрія • цитоплазма Біологічний процес • mitotic telomere maintenance via semi-conservative replication • mitochondrial DNA repair • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • DNA double-strand break processing • mitochondrial DNA replication • cellular response to DNA damage stimulus • DNA replication checkpoint signaling • positive regulation of DNA replication • обмін речовин • base-excision repair • DNA replication, removal of RNA primer • реплікація ДНК • telomere maintenance • DNA duplex unwinding • GO:0100026 Репарація ДНК • G-quadruplex DNA unwinding • t-circle formation • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA replication, Okazaki fragment processing • replication fork reversal • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1763	327762
Ensembl	ENSG00000138346	ENSMUSG00000036875
UniProt	P51530	Q6ZQJ5
RefSeq (мРНК)	NM_001080449	NM_177372
RefSeq (білок)	NP_001073918	NP_796346
Локус (UCSC)	Хр. 10: 68.41 – 68.47 Mb	Хр. 10: 62.78 – 62.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNA2 (англ. DNA replication helicase/nuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 120 415.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQLNELELL		MEKSFWEEAE		LPAELFQKKV		VASFPRTVLS		TGMDNRYLVL
AVNTVQNKEG		NCEKRLVITA		SQSLENKELC		ILRNDWCSVP		VEPGDIIHLE
GDCTSDTWII		DKDFGYLILY		PDMLISGTSI		ASSIRCMRRA		VLSETFRSSD
PATRQMLIGT		VLHEVFQKAI		NNSFAPEKLQ		ELAFQTIQEI		RHLKEMYRLN
LSQDEIKQEV		EDYLPSFCKW		AGDFMHKNTS		TDFPQMQLSL		PSDNSKDNST
CNIEVVKPMD		IEESIWSPRF		GLKGKIDVTV		GVKIHRGYKT		KYKIMPLELK
TGKESNSIEH		RSQVVLYTLL		SQERRADPEA		GLLLYLKTGQ		MYPVPANHLD
KRELLKLRNQ		MAFSLFHRIS		KSATRQKTQL		ASLPQIIEEE		KTCKYCSQIG
NCALYSRAVE		QQMDCSSVPI		VMLPKIEEET		QHLKQTHLEY		FSLWCLMLTL
ESQSKDNKKN		HQNIWLMPAS		EMEKSGSCIG		NLIRMEHVKI		VCDGQYLHNF
QCKHGAIPVT		NLMAGDRVIV		SGEERSLFAL		SRGYVKEINM		TTVTCLLDRN
LSVLPESTLF		RLDQEEKNCD		IDTPLGNLSK		LMENTFVSKK		LRDLIIDFRE
PQFISYLSSV		LPHDAKDTVA		CILKGLNKPQ		RQAMKKVLLS		KDYTLIVGMP
GTGKTTTICT		LVRILYACGF		SVLLTSYTHS		AVDNILLKLA		KFKIGFLRLG
QIQKVHPAIQ		QFTEQEICRS		KSIKSLALLE		ELYNSQLIVA		TTCMGINHPI
FSRKIFDFCI		VDEASQISQP		ICLGPLFFSR		RFVLVGDHQQ		LPPLVLNREA
RALGMSESLF		KRLEQNKSAV		VQLTVQYRMN		SKIMSLSNKL		TYEGKLECGS
DKVANAVINL		RHFKDVKLEL		EFYADYSDNP		WLMGVFEPNN		PVCFLNTDKV
PAPEQVEKGG		VSNVTEAKLI		VFLTSIFVKA		GCSPSDIGII		APYRQQLKII
NDLLARSIGM		VEVNTVDKYQ		GRDKSIVLVS		FVRSNKDGTV		GELLKDWRRL
NVAITRAKHK		LILLGCVPSL		NCYPPLEKLL		NHLNSEKLII		DLPSREHESL
CHILGDFQRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Masuda-Sasa T., Imamura O., Campbell J.L. (2006). Biochemical analysis of human Dna2. Nucleic Acids Res. 34: 1865—1875. PMID 16595800 DOI:10.1093/nar/gkl070
• Balakrishnan L., Stewart J., Polaczek P., Campbell J.L., Bambara R.A. (2010). Acetylation of Dna2 endonuclease/helicase and flap endonuclease 1 by p300 promotes DNA stability by creating long flap intermediates. J. Biol. Chem. 285: 4398—4404. PMID 20019387 DOI:10.1074/jbc.M109.086397
• Gloor J.W., Balakrishnan L., Campbell J.L., Bambara R.A. (2012). Biochemical analyses indicate that binding and cleavage specificities define the ordered processing of human Okazaki fragments by Dna2 and FEN1. Nucleic Acids Res. 40: 6774—6786. PMID 22570407 DOI:10.1093/nar/gks388

Див. також

• Хромосома 10