DNASE1

DNASE1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AWN
Ідентифікатори
Символи	DNASE1, DNL1, DRNI, deoxyribonuclease I, deoxyribonuclease 1
Зовнішні ІД	OMIM: 125505 MGI: 103157 HomoloGene: 3826 GeneCards: DNASE1
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • endonuclease activity • deoxyribonuclease I activity • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • deoxyribonuclease activity • DNA binding Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • nuclear envelope • клітинне ядро Біологічний процес • DNA catabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0097285 апоптоз • DNA catabolic process, endonucleolytic • neutrophil activation involved in immune response • regulation of acute inflammatory response • regulation of neutrophil mediated cytotoxicity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1773	13419
Ensembl	ENSG00000213918	ENSMUSG00000005980
UniProt	P24855	P49183
RefSeq (мРНК)	NM_005223 NM_001351825 NM_001387135 NM_001387139 NM_001387140 NM_001387141	NM_010061 NM_001357143
RefSeq (білок)	NP_005214 NP_001338754	NP_034191 NP_001344072
Локус (UCSC)	Хр. 16: 3.61 – 3.68 Mb	Хр. 16: 3.85 – 3.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNASE1 (англ. Deoxyribonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 31 434.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGMKLLGAL		LALAALLQGA		VSLKIAAFNI		QTFGETKMSN		ATLVSYIVQI
LSRYDIALVQ		EVRDSHLTAV		GKLLDNLNQD		APDTYHYVVS		EPLGRNSYKE
RYLFVYRPDQ		VSAVDSYYYD		DGCEPCGNDT		FNREPAIVRF		FSRFTEVREF
AIVPLHAAPG		DAVAEIDALY		DVYLDVQEKW		GLEDVMLMGD		FNAGCSYVRP
SQWSSIRLWT		SPTFQWLIPD		SADTTATPTH		CAYDRIVVAG		MLLRGAVVPD
SALPFNFQAA		YGLSDQLAQA		ISDHYPVEVM		LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іоном кальцію. Локалізований у ядрі. Також секретований назовні.

Література

• Shak S., Capon D.J., Hellmiss R., Marsters S.A., Baker C.L. (1990). Recombinant human DNase I reduces the viscosity of cystic fibrosis sputum. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 9188—9192. PMID 2251263 DOI:10.1073/pnas.87.23.9188
• Yasuda T., Kishi K., Yanagawa Y., Yoshida A. (1995). Structure of the human deoxyribonuclease I (DNase I) gene: identification of the nucleotide substitution that generates its classical genetic polymorphism. Ann. Hum. Genet. 59: 1—15. PMID 7762978 DOI:10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., Tenjo E., Kishi K. (1995). Molecular analysis of the third allele of human deoxyribonuclease I polymorphism. Ann. Hum. Genet. 59: 139—147. PMID 7625762 DOI:10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x
• Yasuda T., Takeshita H., Iida R., Kogure S., Kishi K. (1999). A new allele, DNASE1*6, of human deoxyribonuclease I polymorphism encodes an Arg to Cys substitution responsible for its instability. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 280—283. PMID 10381379 DOI:10.1006/bbrc.1999.0900

Див. також

• Хромосома 16