DNTTIP1

DNTTIP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MWI, 4D6K
Ідентифікатори
Символи	DNTTIP1, C20orf167, Tdif1, dJ447F3.4, deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1, deoxynucleotidyltransferase terminal interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611388 MGI: 1923483 HomoloGene: 14189 GeneCards: DNTTIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • nucleosome binding • DNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерце • histone deacetylase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116092	76233
Ensembl	ENSG00000101457	ENSMUSG00000017299
UniProt	Q9H147	Q99LB0
RefSeq (мРНК)	NM_052951	NM_133763
RefSeq (білок)	NP_443183	NP_598524
Локус (UCSC)	Хр. 20: 45.79 – 45.81 Mb	Хр. 2: 164.59 – 164.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNTTIP1 (англ. Deoxynucleotidyltransferase terminal interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 329 амінокислот, а молекулярна маса — 37 013.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGATGDAEQP		RGPSGAERGG		LELGDAGAAG		QLVLTNPWNI		MIKHRQVQRR
GRRSQMTTSF		TDPAISMDLL		RAVLQPSINE		EIQTVFNKYM		KFFQKAALNV
RDNVGEEVDA		EQLIQEACRS		CLEQAKLLFS		DGEKVIPRLT		HELPGIKRGR
QAEEECAHRG		SPLPKKRKGR		PPGHILSSDR		AAAGMVWKPK		SCEPIRREGP
KWDPARLNES		TTFVLGSRAN		KALGMGGTRG		RIYIKHPHLF		KYAADPQDKH
WLAEQHHMRA		TGGKMAYLLI		EEDIRDLAAS		DDYRGCLDLK		LEELKSFVLP
SWMVEKMRKY		METLRTENEH		RAVEAPPQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kubota T., Koiwai O., Hori K., Watanabe N., Koiwai K. (2013). TdIF1 recognizes a specific DNA sequence through its Helix-Turn-Helix and AT-hook motifs to regulate gene transcription. PLoS ONE. 8: E66710—E66710. PMID 23874396 DOI:10.1371/journal.pone.0066710

Див. також

• Хромосома 20