DUSP11

DUSP11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4MBB, 4NYH
Ідентифікатори
Символи	DUSP11, PIR1, dual specificity phosphatase 11
Зовнішні ІД	OMIM: 603092 MGI: 1919352 HomoloGene: 31183 GeneCards: DUSP11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • hydrolase activity • polynucleotide 5'-phosphatase activity • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • fibrillar center • клітинне ядро • intercellular bridge Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA metabolic process • polynucleotide 5' dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0016576 protein dephosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8446	72102
Ensembl	ENSG00000144048	ENSMUSG00000030002
UniProt	O75319	Q6NXK5
RefSeq (мРНК)	NM_003584	NM_028099
RefSeq (білок)	NP_003575	NP_082375
Локус (UCSC)	Хр. 2: 73.76 – 73.78 Mb	Хр. 6: 85.92 – 85.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DUSP11 (англ. Dual specificity phosphatase 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 38 939.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQWHHPRSG		WGRRRDFSGR		SSAKKKGGNH		IPERWKDYLP		VGQRMPGTRF
IAFKVPLQKS		FEKKLAPEEC		FSPLDLFNKI		REQNEELGLI		IDLTYTQRYY
KPEDLPETVP		YLKIFTVGHQ		VPDDETIFKF		KHAVNGFLKE		NKDNDKLIGV
HCTHGLNRTG		YLICRYLIDV		EGVRPDDAIE		LFNRCRGHCL		ERQNYIEDLQ
NGPIRKNWNS		SVPRSSDFED		SAHLMQPVHN		KPVKQGPRYN		LHQIQGHSAP
RHFHTQTQSL		QQSVRKFSEN		PHVYQRHHLP		PPGPPGEDYS		HRRYSWNVKP
NASRAAQDRR		RWYPYNYSRL		SYPACWEWTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Yuan Y., Li D.-M., Sun H. (1998). PIR1, a novel phosphatase that exhibits high affinity to RNA ribonucleoprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 20347—20353. PMID 9685386 DOI:10.1074/jbc.273.32.20347
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Deshpande T., Takagi T., Hao L., Buratowski S., Charbonneau H. (1999). Human PIR1 of the protein-tyrosine phosphatase superfamily has RNA 5'-triphosphatase and diphosphatase activities. J. Biol. Chem. 274: 16590—16594. PMID 10347225 DOI:10.1074/jbc.274.23.16590
• Sankhala R.S., Lokareddy R.K., Cingolani G. (2014). Structure of human PIR1, an atypical dual-specificity phosphatase. Biochemistry. 53: 862—871. PMID 24447265 DOI:10.1021/bi401240x

Див. також

• Хромосома 2