DXO

DXO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FQI, 3FQJ, 4J7L, 4J7M, 4J7N
Ідентифікатори
Символи	DXO, DOM3L, DOM3Z, NG6, RAI1, decapping exoribonuclease
Зовнішні ІД	OMIM: 605996 MGI: 1890444 HomoloGene: 38061 GeneCards: DXO
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • nuclease activity • 5'-3' exonuclease activity • exonuclease activity • mRNA binding • RNA pyrophosphohydrolase activity • hydrolase activity • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • mRNA catabolic process • RNA destabilization • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1797	112403
Ensembl	ENSG00000204348 ENSG00000236765 ENSG00000224313 ENSG00000206346 ENSG00000225682 ENSG00000234798	ENSMUSG00000040482
UniProt	O77932	O70348
RefSeq (мРНК)	NM_005510 NM_001371205 NM_001371206	NM_001163770 NM_033613
RefSeq (білок)	NP_005501 NP_001358134 NP_001358135	NP_001157242 NP_291091
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.97 – 31.97 Mb	Хр. 17: 35.06 – 35.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DXO (англ. Decapping exoribonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 44 929.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPRGTKRGA		EKTEVAEPRN		KLPRPAPSLP		TDPALYSGPF		PFYRRPSELG
CFSLDAQRQY		HGDARALRYY		SPPPTNGPGP		NFDLRDGYPD		RYQPRDEEVQ
ERLDHLLCWL		LEHRGRLEGG		PGWLAEAIVT		WRGHLTKLLT		TPYERQEGWQ
LAASRFQGTL		YLSEVETPNA		RAQRLARPPL		LRELMYMGYK		FEQYMCADKP
GSSPDPSGEV		NTNVAFCSVL		RSRLGSHPLL		FSGEVDCTDP		QAPSTQPPTC
YVELKTSKEM		HSPGQWRSFY		RHKLLKWWAQ		SFLPGVPNVV		AGFRNPDGFV
SSLKTFPTMK		MFEYVRNDRD		GWNPSVCMNF		CAAFLSFAQS		TVVQDDPRLV
HLFSWEPGGP		VTVSVHQDAP		YAFLPIWYVE		AMTQDLPSPP		KTPSPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Yang Z., Shen L., Dangel A.W., Wu L.-C., Yu C.Y. (1998). Four ubiquitously expressed genes, RD (D6S45)-SKI2W (SKIV2L)-DOM3Z-RP1 (D6S60E), are present between complement component genes factor B and C4 in the class III region of the HLA. Genomics. 53: 338—347.  PMID 9799600 DOI:10.1006/geno.1998.5499
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zheng D., Chen C.Y., Shyu A.B. (2011). Unraveling regulation and new components of human P-bodies through a protein interaction framework and experimental validation. RNA. 17: 1619—1634.  PMID 21750099 DOI:10.1261/rna.2789611
• Yang Z., Yu C.Y. (2000). Organizations and gene duplications of the human and mouse MHC complement gene clusters. Exp. Clin. Immunogenet. 17: 1—17.  PMID 10686478

Див. також

• Хромосома 6