EPG5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
EPG5
Ідентифікатори
Символи EPG5, HEEW1, KIAA1632, VICIS, hectopic P-granules autophagy protein 5 homolog (C. elegans), ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog, ectopic P-granules 5 autophagy tethering factor
Зовнішні ІД OMIM: 615068 MGI: 1918673 HomoloGene: 14575 GeneCards: EPG5
Пов'язані генетичні захворювання
Vici syndrome[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_020964
NM_001195633
RefSeq (білок)
NP_066015
NP_001182562
Локус (UCSC) Хр. 18: 45.85 – 45.97 Mb н/д
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EPG5 (англ. Ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 579 амінокислот, а молекулярна маса — 292 481[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAEAVKPQRRAKAKASRTKTKEKKKYETPQREESSEVSLPKTSREQEIPS
LACEFKGDHLKVVTDSQLQDDASGQNESEMFDVPLTSLTISNEESLTCNT
EPPKEGGEARPCVGDSAVTPKVHPGDNVGTKVETPKNFTEVEENMSVQGG
LSESAPQSNFSYTQPAMENIQVRETQNSKEDKQGLVCSSEVPQNVGLQSS
CPAKHGFQTPRVKKLYPQLPAEIAGEAPALVAVKPLLRSERLYPELPSQL
ELVPFTKEQLKILEPGSWLENVESYLEEFDSMAHQDRHEFYELLLNYSRC
RKQLLLAEAELLTLTSDCQNAKSRLWQFKEEQMSVQGICADQVKVFSYHR
YQRVEMNENALVELKKLFDAKSEHLHQTLALHSYTSVLSRLQVESYIYAL
LSSSAVLRSSAIHQQGRASKQTESIPSDLCQLKECISVLFMFTRRVNEDT
QFHDDILLWLQKLVSVLQRVGCPGDHLFLLNHILRCPAGVSKWAVPFIQI
KVLHNPSGVFHFMQSLALLMSPVKNRAEFMCHMKPSERKPSSSGPGSGTW
TLVDEGGEEDEDPETSWILLNEDDLVTILAQFPFHELFQHLLGFKAKGDY
LPETTRPQEMMKIFAFANSLVELLAVGLETFNRARYRQFVKRIGYMIRMT
LGYVSDHWAQYVSHNQGSGLAQQPYSMEKLQVEFDELFLRAVLHVLKAKR
LGIWLFMSEMPFGTLSVQMLWKLFYLMHQVESENLQQLSSSLQPAQCKQQ
LQDPEHFTNFEKCLSSMNSSEEICLLTTFAQMAQARRTNVDEDFIKIIVL
EIYEVSYVTLSTRETFSKVGRELLGTITAVHPEIISVLLDRVQETIDQVG
MVSLYLFKELPLYLWQPSASEIAVIRDWLLNYNLTVVKNKLACVILEGLN
WGFAKQATLHLDQAVHAEVALMVLEAYQKYLAQKPYAGILSESMKQVSYL
ASIVRYGETPETSFNQWAWNLILRLKLHKNDYGIQPNCPAVPFSVTVPDM
TESPTFHPLLKAVKAGMPIGCYLALSMTAVGHSIEKFCAEGIPLLGILVQ
SRHLRTVVHVLDKILPLFYPCQYYLLKNEQFLSHLLLFLHLDSGVPQGVT
QQVTHKVAQHLTGASHGDNVKLLNSMIQAHISVSTQPNEVGPVAVLEFWV
QALISQHLWYREQPILFLMDHLCKAAFQLMQEDCIQKLLYQQHKNALGYH
CDRSLLSSLVSWIVAGNITPSFVEGLATPTQVWFAWTVLNMESIFEEDSQ
LRRVIEGELVINSAFTPDQALKKAQTQLKLPIVPSLQRLLIYRWAHQALV
TPSDHPLLPLIWQKFFLLYLHRPGPQYGLPIDGCIGRRFFQSPAHINLLK
EMKRRLTEVADFHHAASKALRVPAEGSEGLPESHSGTPGYLTSPELHKEL
VRLFNVYILWLEDENFQKGDTYIPSLPKHYDIHRLAKVMQNQQDLWMEYL
NMERIYHEFQETVGLWTQAKLESHSTPCSLSVQLDFTDPLLAKERVLSNL
RKHEAPQPPLALHPTKPPVPVISSAVLLSQKDATQLVCTDLNLLQQQART
AALRESQQVALDGELLDTMPKQYVNREEQTTLHLECRGSSGKKCQGAAVV
TVQFEGMHKNEAISQQLHVLRKEVKQLQAEAAKPPSLNIVEAAVHAENLI
TALVNAYKLQPTPGIQKVGISLFFTIVDYVSDETQRHPPTRQFFTSCIEI
LGQVFISGIKSECRKVLETILKNSRLCSLLSPFFTPNAAPAEFIQLYEQV
VKFLSEDNSDMIFMLLTKFDLKQWLSATKPPLSDRTRLLESIHLALTAWG
LEPDEDILMPFNLFCKHWTYLLLYQFPDQYSDILRLLMQSSAEQLLSPEC
WKATLRALGCCAPSCQQGAASTEGAVLPSSSDALLSDKQVMETIQWLSDF
FYKLRLSKMDFKSFGLFSKWSPYMADVKTFLGYLVKRLIDLEMTCLAQDP
TASRKTVLKSLHSVIIQLFKPWILVLEDNESSQQRHYPWLESDTVVASSI
VQLFTDCIDSLHESFKDKLLPGDAGALWLHLMHYCEACTAPKMPEFILYA
FHSTYRKLPWKDLHPDQMLMEAFFKVERGSPKSCFLFLGSVLCEVNWVSV
LSDAWNSSPHPETRSMIVCLLFMMILLAKEVQLVDQTDSPLLSLLGQTSS
LSWHLVDIVSYQSVLSYFSSHYPPSIILAKESYAELIMKLLKVSAGLSIP
TDSQKHLDAVPKCQAFTHQMVQFLSTLEQNGKITLAVLEQEMSKLLDDII
VFNPPDMDSQTRHMALSSLFMEVLMMMNNATIPTAEFLRGSIRTWIGQKM
HGLVVLPLLTAACQSLASVRHMAETTEACITAYFKESPLNQNSGWGPILV
SLQVPELTMEEFLQECLTLGSYLTLYVYLLQCLNSEQTLRNEMKVLLILS
KWLEQVYPSSVEEEAKLFLWWHQVLQLSLIQTEQNDSVLTESVIRILLLV
QSRQNLVAEERLSSGILGAIGFGRKSPLSNRFRVVARSMAAFLSVQVPME
DQIRLRPGSELHLTPKAQQALNALESMASSKQYVEYQDQILQATQFIRHP
GHCLQDGKSFLALLVNCLYPEVHYLDHIR

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]