EPHB1

EPHB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DJS, 2EAO, 3ZFX
Ідентифікатори
Символи	EPHB1, Ephb1, 9330129L11, AW488255, C130099E04Rik, Cek6, ENSMUSG00000074119, Elk, Elkh, Hek6, Net, EPHT2, EPH receptor B1, ELK, NET
Зовнішні ІД	OMIM: 600600 MGI: 1096337 HomoloGene: 20936 GeneCards: EPHB1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • ephrin receptor activity • axon guidance receptor activity • transmembrane-ephrin receptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • cell projection • early endosome membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • дендрит (нейробіологія) • екзосома • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • клітинна мембрана • аксон • цитоплазма • filopodium tip • membrane raft • neuron projection • receptor complex • glutamatergic synapse Біологічний процес • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • нейробіологія розвитку • dendritic spine development • cell-substrate adhesion • regulation of JNK cascade • protein phosphorylation • адгезія клітин • regulation of neuron death • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • protein autophosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • immunological synapse formation • axon guidance • optic nerve morphogenesis • central nervous system projection neuron axonogenesis • retinal ganglion cell axon guidance • ephrin receptor signaling pathway • camera-type eye morphogenesis • positive regulation of synapse assembly • dendritic spine morphogenesis • Ангіогенез • skeletal muscle satellite cell activation • cranial nerve development • Нейрогенез • establishment of cell polarity • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • cell chemotaxis • neural precursor cell proliferation • negative regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation • negative regulation of satellite cell differentiation • modulation of chemical synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2047	270190
Ensembl	ENSG00000154928	ENSMUSG00000032537
UniProt	P54762	Q8CBF3
RefSeq (мРНК)	NM_004441	NM_001168296 NM_173447
RefSeq (білок)	NP_004432	NP_001161768 NP_775623
Локус (UCSC)	Хр. 3: 134.8 – 135.26 Mb	Хр. 9: 101.8 – 102.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EPHB1 (англ. EPH receptor B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 984 амінокислот, а молекулярна маса — 109 885.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALDYLLLLL		LASAVAAMEE		TLMDTRTATA		ELGWTANPAS		GWEEVSGYDE
NLNTIRTYQV		CNVFEPNQNN		WLLTTFINRR		GAHRIYTEMR		FTVRDCSSLP
NVPGSCKETF		NLYYYETDSV		IATKKSAFWS		EAPYLKVDTI		AADESFSQVD
FGGRLMKVNT		EVRSFGPLTR		NGFYLAFQDY		GACMSLLSVR		VFFKKCPSIV
QNFAVFPETM		TGAESTSLVI		ARGTCIPNAE		EVDVPIKLYC		NGDGEWMVPI
GRCTCKPGYE		PENSVACKAC		PAGTFKASQE		AEGCSHCPSN		SRSPAEASPI
CTCRTGYYRA		DFDPPEVACT		SVPSGPRNVI		SIVNETSIIL		EWHPPRETGG
RDDVTYNIIC		KKCRADRRSC		SRCDDNVEFV		PRQLGLTECR		VSISSLWAHT
PYTFDIQAIN		GVSSKSPFPP		QHVSVNITTN		QAAPSTVPIM		HQVSATMRSI
TLSWPQPEQP		NGIILDYEIR		YYEKEHNEFN		SSMARSQTNT		ARIDGLRPGM
VYVVQVRART		VAGYGKFSGK		MCFQTLTDDD		YKSELREQLP		LIAGSAAAGV
VFVVSLVAIS		IVCSRKRAYS		KEAVYSDKLQ		HYSTGRGSPG		MKIYIDPFTY
EDPNEAVREF		AKEIDVSFVK		IEEVIGAGEF		GEVYKGRLKL		PGKREIYVAI
KTLKAGYSEK		QRRDFLSEAS		IMGQFDHPNI		IRLEGVVTKS		RPVMIITEFM
ENGALDSFLR		QNDGQFTVIQ		LVGMLRGIAA		GMKYLAEMNY		VHRDLAARNI
LVNSNLVCKV		SDFGLSRYLQ		DDTSDPTYTS		SLGGKIPVRW		TAPEAIAYRK
FTSASDVWSY		GIVMWEVMSF		GERPYWDMSN		QDVINAIEQD		YRLPPPMDCP
AALHQLMLDC		WQKDRNSRPR		FAEIVNTLDK		MIRNPASLKT		VATITAVPSQ
PLLDRSIPDF		TAFTTVDDWL		SAIKMVQYRD		SFLTAGFTSL		QLVTQMTSED
LLRIGITLAG		HQKKILNSIH		SMRVQISQSP		TAMA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, ендосомах.

Література

• Stein E., Huynh-Do U., Lane A.A., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1998). Nck recruitment to Eph receptor, EphB1/ELK, couples ligand activation to c-Jun kinase. J. Biol. Chem. 273: 1303—1308. PMID 9430661 DOI:10.1074/jbc.273.3.1303
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Stein E., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1996). Ligand activation of ELK receptor tyrosine kinase promotes its association with Grb10 and Grb2 in vascular endothelial cells. J. Biol. Chem. 271: 23588—23593. PMID 8798570 DOI:10.1074/jbc.271.38.23588
• Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 DOI:10.1074/jbc.M108011200
• Han D.C., Shen T.L., Miao H., Wang B., Guan J.L. (2002). EphB1 associates with Grb7 and regulates cell migration. J. Biol. Chem. 277: 45655—45661. PMID 12223469 DOI:10.1074/jbc.M203165200

Див. також

• Хромосома 3