FAM20B

FAM20B
Ідентифікатори
Символи	FAM20B, gxk1, family with sequence similarity 20 member B, glycosaminoglycan xylosylkinase, FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase
Зовнішні ІД	OMIM: 611063 MGI: 2443990 HomoloGene: 8909 GeneCards: FAM20B
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • нуклеоплазма Біологічний процес • фосфорилювання • protein phosphorylation • proteoglycan biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9917	215015
Ensembl	ENSG00000116199	ENSMUSG00000033557
UniProt	O75063	Q8VCS3
RefSeq (мРНК)	NM_014864 NM_001324310 NM_001324311	NM_145413
RefSeq (білок)	NP_001311239 NP_001311240 NP_055679	NP_663388
Локус (UCSC)	Хр. 1: 179.03 – 179.08 Mb	Хр. 1: 156.51 – 156.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FAM20B (англ. FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 46 432.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLKQRVVLL		AILLVIFIFT		KVFLIDNLDT		SAANREDQRA		FHRMMTGLRV
ELAPKLDHTL		QSPWEIAAQW		VVPREVYPEE		TPELGAVMHA		MATKKIIKAD
VGYKGTQLKA		LLILEGGQKV		VFKPKRYSRD		HVVEGEPYAG		YDRHNAEVAA
FHLDRILGFH		RAPLVVGRFV		NLRTEIKPVA		TEQLLSTFLT		VGNNTCFYGK
CYYCRETEPA		CADGDIMEGS		VTLWLPDVWP		LQKHRHPWGR		TYREGKLARW
EYDESYCDAV		KKTSPYDSGP		RLLDIIDTAV		FDYLIGNADR		HHYESFQDDE
GASMLILLDN		AKSFGNPSLD		ERSILAPLYQ		CCIIRVSTWN		RLNYLKNGVL
KSALKSAMAH		DPISPVLSDP		HLDAVDQRLL		SVLATVKQCT		DQFGMDTVLV
EDRMPLSHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• Koike T., Izumikawa T., Tamura J., Kitagawa H. (2009). FAM20B is a kinase that phosphorylates xylose in the glycosaminoglycan-protein linkage region. Biochem. J. 421: 157—162. PMID 19473117 doi:10.1042/BJ20090474
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Koike T., Izumikawa T., Sato B., Kitagawa H. (2014). Identification of phosphatase that dephosphorylates xylose in the glycosaminoglycan-protein linkage region of proteoglycans. J. Biol. Chem. 289: 6695—6708. PMID 24425863 doi:10.1074/jbc.M113.520536

Див. також

• Хромосома 1