FNTB

FNTB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JCQ, 1LD7, 1LD8, 1MZC, 1S63, 1SA4, 1TN6, 2F0Y, 2H6F, 2H6G, 2H6H, 2H6I, 2IEJ, 3E37
Ідентифікатори
Символи	FNTB, FPTB, farnesyltransferase, CAAX box, beta
Зовнішні ІД	OMIM: 134636 MGI: 1861305 HomoloGene: 1535 GeneCards: FNTB
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • transferase activity • prenyltransferase activity • каталітична активність • protein farnesyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • farnesyltranstransferase activity • zinc ion binding • isoprenoid binding • пептидний зв'язок Клітинна компонента • гіалоплазма • protein farnesyltransferase complex • microtubule associated complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • protein farnesylation • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of cell population proliferation • response to inorganic substance • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to cytokine • Загоєння ран • positive regulation of cell cycle • positive regulation of fibroblast proliferation • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • protein prenylation • regulation of fibroblast proliferation • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2342	110606
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000033373
UniProt	P49356	Q8K2I1
RefSeq (мРНК)	NM_002028	NM_145927
RefSeq (білок)	NP_002019 NP_001189487 NP_001189488	NP_666039
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 12: 76.81 – 76.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FNTB (англ. Farnesyltransferase, CAAX box, beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 48 774.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASPSSFTYY		CPPSSSPVWS		EPLYSLRPEH		ARERLQDDSV		ETVTSIEQAK
VEEKIQEVFS		SYKFNHLVPR		LVLQREKHFH		YLKRGLRQLT		DAYECLDASR
PWLCYWILHS		LELLDEPIPQ		IVATDVCQFL		ELCQSPEGGF		GGGPGQYPHL
APTYAAVNAL		CIIGTEEAYD		IINREKLLQY		LYSLKQPDGS		FLMHVGGEVD
VRSAYCAASV		ASLTNIITPD		LFEGTAEWIA		RCQNWEGGIG		GVPGMEAHGG
YTFCGLAALV		ILKRERSLNL		KSLLQWVTSR		QMRFEGGFQG		RCNKLVDGCY
SFWQAGLLPL		LHRALHAQGD		PALSMSHWMF		HQQALQEYIL		MCCQCPAGGL
LDKPGKSRDF		YHTCYCLSGL		SIAQHFGSGA		MLHDVVLGVP		ENALQPTHPV
YNIGPDKVIQ		ATTYFLQKPV		PGFEELKDET		SAEPATD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Long S.B., Hancock P.J., Kral A.M., Hellinga H.W., Beese L.S. (2001). The crystal structure of human protein farnesyltransferase reveals the basis for inhibition by CaaX tetrapeptides and their mimetics. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12948—12953. PMID 11687658 DOI:10.1073/pnas.241407898
• Reid T.S., Terry K.L., Casey P.J., Beese L.S. (2004). Crystallographic analysis of CaaX prenyltransferases complexed with substrates defines rules of protein substrate selectivity. J. Mol. Biol. 343: 417—433. PMID 15451670 DOI:10.1016/j.jmb.2004.08.056
• Terry K.L., Casey P.J., Beese L.S. (2006). Conversion of protein farnesyltransferase to a geranylgeranyltransferase. Biochemistry. 45: 9746—9755. PMID 16893176 DOI:10.1021/bi060295e

Див. також

• Хромосома 14