FTO

FTO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LFM, 4IDZ, 4IE0, 4IE4, 4IE5, 4IE6, 4IE7, 4CXW, 4CXX, 4CXY, 4QHO, 4QKN, 4ZS3, 4ZS2
Ідентифікатори
Символи	FTO, ALKBH9, GDFD, BMIQ14, fat mass and obesity associated, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase
Зовнішні ІД	OMIM: 610966 MGI: 1347093 HomoloGene: 8053 GeneCards: FTO
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, ожиріння, morbid obesity, меланома, остеоартроз, метаболічні захворювання, хронічне обструктивне захворювання легень, lethal polymalformative syndrome, Boissel type
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidative DNA demethylase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • mRNA N6-methyladenosine dioxygenase activity • oxidative RNA demethylase activity Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • regulation of multicellular organism growth • regulation of respiratory system process • regulation of white fat cell proliferation • cellular response to DNA damage stimulus • oxidative demethylation • oxidative single-stranded RNA demethylation • regulation of lipid storage • RNA repair • adipose tissue development • DNA demethylation • regulation of brown fat cell differentiation • temperature homeostasis • oxidative single-stranded DNA demethylation • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA dealkylation involved in DNA repair Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79068	26383
Ensembl	ENSG00000140718	ENSMUSG00000055932
UniProt	Q9C0B1	Q8BGW1
RefSeq (мРНК)	NM_001080432	NM_011936
RefSeq (білок)	NP_001073901 NP_001350820 NP_001350823 NP_001350825 NP_001350826 NP_001350827 NP_001350828 NP_001350829 NP_001350830 NP_001350832 NP_001350834 NP_001350917	NP_036066
Локус (UCSC)	Хр. 16: 53.7 – 54.16 Mb	Хр. 8: 92.04 – 92.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FTO (англ. FTO, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 58 282.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRTPTAEER		EREAKKLRLL		EELEDTWLPY		LTPKDDEFYQ		QWQLKYPKLI
LREASSVSEE		LHKEVQEAFL		TLHKHGCLFR		DLVRIQGKDL		LTPVSRILIG
NPGCTYKYLN		TRLFTVPWPV		KGSNIKHTEA		EIAAACETFL		KLNDYLQIET
IQALEELAAK		EKANEDAVPL		CMSADFPRVG		MGSSYNGQDE		VDIKSRAAYN
VTLLNFMDPQ		KMPYLKEEPY		FGMGKMAVSW		HHDENLVDRS		AVAVYSYSCE
GPEEESEDDS		HLEGRDPDIW		HVGFKISWDI		ETPGLAIPLH		QGDCYFMLDD
LNATHQHCVL		AGSQPRFSST		HRVAECSTGT		LDYILQRCQL		ALQNVCDDVD
NDDVSLKSFE		PAVLKQGEEI		HNEVEFEWLR		QFWFQGNRYR		KCTDWWCQPM
AQLEALWKKM		EGVTNAVLHE		VKREGLPVEQ		RNEILTAILA		SLTARQNLRR
EWHARCQSRI		ARTLPADQKP		ECRPYWEKDD		ASMPLPFDLT		DIVSELRGQL
LEAKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16