G3BP1

G3BP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3Q90, 4FCJ, 4FCM, 4IIA
Ідентифікатори
Символи	G3BP1, G3BP, HDH-VIII, G3BP stress granule assembly factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608431 MGI: 1351465 HomoloGene: 38096 GeneCards: G3BP1
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0004003 DNA helicase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • nuclease activity; • endonuclease activity; • ATP binding; • hydrolase activity; • mRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • cytoplasmic stress granule; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • перикаріон; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • Ras protein signal transduction; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • DNA duplex unwinding; • GO:0015915 транспорт; • stress granule assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10146
	27041
	ENSG00000145907
	ENSMUSG00000018583
	Q13283
	P97855
	NM_005754; NM_198395
	NM_013716
	NP_005745; NP_938405
	NP_038744
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

G3BP1 (англ. G3BP stress granule assembly factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 52 164^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVMEKPSPLL	VGREFVRQYY	TLLNQAPDML	HRFYGKNSSY	VHGGLDSNGK
PADAVYGQKE	IHRKVMSQNF	TNCHTKIRHV	DAHATLNDGV	VVQVMGLLSN
NNQALRRFMQ	TFVLAPEGSV	ANKFYVHNDI	FRYQDEVFGG	FVTEPQEESE
EEVEEPEERQ	QTPEVVPDDS	GTFYDQAVVS	NDMEEHLEEP	VAEPEPDPEP
EPEQEPVSEI	QEEKPEPVLE	ETAPEDAQKS	SSPAPADIAQ	TVQEDLRTFS
WASVTSKNLP	PSGAVPVTGI	PPHVVKVPAS	QPRPESKPES	QIPPQRPQRD
QRVREQRINI	PPQRGPRPIR	EAGEQGDIEP	RRMVRHPDSH	QLFIGNLPHE
VDKSELKDFF	QSYGNVVELR	INSGGKLPNF	GFVVFDDSEP	VQKVLSNRPI
MFRGEVRLNV	EEKKTRAARE	GDRRDNRLRG	PGGPRGGLGG	GMRGPPRGGM
VQKPGFGVGR	GLAPRQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Costa M., Ochem A., Staub A., Falaschi A. (1999). Human DNA helicase VIII: a DNA and RNA helicase corresponding to the G3BP protein, an element of the ras transduction pathway. Nucleic Acids Res. 27: 817—821. PMID 9889278 DOI:10.1093/nar/27.3.817
Soncini C., Berdo I., Draetta G. (2001). Ras-GAP SH3 domain binding protein (G3BP) is a modulator of USP10, a novel human ubiquitin specific protease. Oncogene. 20: 3869—3879. PMID 11439350 DOI:10.1038/sj.onc.1204553
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з G3BP stress granule assembly factor 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30292 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13283 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з G3BP stress granule assembly factor 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30292 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q13283 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

G3BP1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук