GABPB1

GABPB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AWC
Ідентифікатори
Символи	GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, GA binding protein transcription factor beta subunit 1, GA binding protein transcription factor subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600610 MGI: 95611 HomoloGene: 7723 GeneCards: GABPB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein heterodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mitochondrion organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2553	14391
Ensembl	ENSG00000104064	ENSMUSG00000027361
UniProt	Q06547	Q00420
RefSeq (мРНК)	NM_002041 NM_005254 NM_016654 NM_016655 NM_181427 NM_001320910 NM_001320915	NM_001271467 NM_001271468 NM_001271469 NM_001271470 NM_001271492 NM_010249 NM_207669 NM_001355108 NM_001355109
RefSeq (білок)	NP_001307839 NP_001307844 NP_002032 NP_005245 NP_057738 NP_057739 NP_852092 NP_057738.1	NP_001258396 NP_001258397 NP_001258398 NP_001258399 NP_001258421 NP_034379 NP_997552 NP_001342037 NP_001342038 NP_001393121 NP_001393122 NP_001393123 NP_001393124 NP_001393125 NP_001393126 NP_001393127 NP_001393128 NP_001393129 NP_001393130 NP_001393131 NP_001393132 NP_001393133 NP_001393134 NP_001393135 NP_001393136 NP_001393137 NP_001393138 NP_001393139 NP_001393140 NP_001393141 NP_001393142 NP_001393143 NP_001393144 NP_001393145 NP_001393146 NP_001393147 NP_001393148 NP_001393149 NP_001393150 NP_001393151 NP_001393152 NP_001393153 NP_001393154 NP_001393155 NP_001393156
Локус (UCSC)	Хр. 15: 50.28 – 50.36 Mb	Хр. 2: 126.47 – 126.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GABPB1 (англ. GA binding protein transcription factor beta subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 42 483.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLVDLGKKL		LEAARAGQDD		EVRILMANGA		PFTTDWLGTS		PLHLAAQYGH
YSTTEVLLRA		GVSRDARTKV		DRTPLHMAAS		EGHASIVEVL		LKHGADVNAK
DMLKMTALHW		ATEHNHQEVV		ELLIKYGADV		HTQSKFCKTA		FDISIDNGNE
DLAEILQIAM		QNQINTNPES		PDTVTIHAAT		PQFIIGPGGV		VNLTGLVSSE
NSSKATDETG		VSAVQFGNSS		TSVLATLAAL		AEASAPLSNS		SETPVVATEE
VVTAESVDGA		IQQVVSSGGQ		QVITIVTDGI		QLGNLHSIPT		SGIGQPIIVT
MPDGQQVLTV		PATDIAEETV		ISEEPPAKRQ		CIEIIENRVE		SAEIEEREAL
QKQLDEANRE		AQKYRQQLLK		KEQEAEAYRQ		KLEAMTRLQT		NKEAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain. Mol. Cell. Biol. 15: 102—111. PMID 7799916 DOI:10.1128/MCB.15.1.102
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Virbasius J.V., Virbasius C.A., Scarpulla R.C. (1993). Identity of GABP with NRF-2, a multisubunit activator of cytochrome oxidase expression, reveals a cellular role for an ETS domain activator of viral promoters. Genes Dev. 7: 380—392. PMID 8383622 DOI:10.1101/gad.7.3.380
• Gugneja S., Virbasius C.M., Scarpulla R.C. (1996). Nuclear respiratory factors 1 and 2 utilize similar glutamine-containing clusters of hydrophobic residues to activate transcription. Mol. Cell. Biol. 16: 5708—5716. PMID 8816484 DOI:10.1128/MCB.16.10.5708
• Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP. EMBO J. 19: 683—690. PMID 10675337 DOI:10.1093/emboj/19.4.683

Див. також

• Хромосома 15