GALK2

GALK2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A2D, 2A2C
Ідентифікатори
Символи	GALK2, GK2, galactokinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 137028 MGI: 1917226 HomoloGene: 13654 GeneCards: GALK2
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • N-acetylgalactosamine kinase activity • ATP binding • galactokinase activity • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor • kinase activity • galactose binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • galactose metabolic process • обмін речовин • carbohydrate phosphorylation • фосфорилювання • carbohydrate metabolic process • galactose catabolic process via UDP-galactose Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2585	69976
Ensembl	ENSG00000156958	ENSMUSG00000027207
UniProt	Q01415	Q68FH4
RefSeq (мРНК)	NM_001001556 NM_001289030 NM_001289031 NM_002044 NM_001352047 NM_001352048	NM_001291002 NM_175154
RefSeq (білок)	NP_001001556 NP_001275959 NP_001275960 NP_002035 NP_001338976 NP_001338977	NP_001277931 NP_780363
Локус (UCSC)	Хр. 15: 49.16 – 49.37 Mb	Хр. 2: 125.7 – 125.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GALK2 (англ. Galactokinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 50 378.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATESPATRR		VQVAEHPRLL		KLKEMFNSKF		GSIPKFYVRA		PGRVNIIGEH
IDYCGYSVLP		MAVEQDVLIA		VEPVKTYALQ		LANTNPLYPD		FSTSANNIQI
DKTKPLWHNY		FLCGLKGIQE		HFGLSNLTGM		NCLVDGNIPP		SSGLSSSSAL
VCCAGLVTLT		VLGRNLSKVE		LAEICAKSER		YIGTEGGGMD		QSISFLAEEG
TAKLIEFSPL		RATDVKLPSG		AVFVIANSCV		EMNKAATSHF		NIRVMECRLA
AKLLAKYKSL		QWDKVLRLEE		VQAKLGISLE		EMLLVTEDAL		HPEPYNPEEI
CRCLGISLEE		LRTQILSPNT		QDVLIFKLYQ		RAKHVYSEAA		RVLQFKKICE
EAPENMVQLL		GELMNQSHMS		CRDMYECSCP		ELDQLVDICR		KFGAQGSRLT
GAGWGGCTVS		MVPADKLPSF		LANVHKAYYQ		RSDGSLAPEK		QSLFATKPGG
GALVLLEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Lee R.T., Peterson C.L., Calman A.F., Herskowitz I., O'Donnell J.J. (1992). Cloning of a human galactokinase gene (GK2) on chromosome 15 by complementation in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 10887—10891. PMID 1438294 doi:10.1073/pnas.89.22.10887
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Ai Y., Basu M., Bergsma D.J., Stambolian D. (1995). Comparison of the enzymatic activities of human galactokinase GALK1 and a related human galactokinase protein GK2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 212: 687—691. PMID 7542884 doi:10.1006/bbrc.1995.2023
• Pastuszak I., O'Donnell J., Elbein A.D. (1996). Identification of the GalNAc kinase amino acid sequence. J. Biol. Chem. 271: 23653—23656. PMID 8798585 doi:10.1074/jbc.271.39.23653
• Thoden J.B., Holden H.M. (2005). The molecular architecture of human N-acetylgalactosamine kinase. J. Biol. Chem. 280: 32784—32791. PMID 16006554 doi:10.1074/jbc.M505730200

Див. також

• Хромосома 15