GALNT1

GALNT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XHB
Ідентифікатори
Символи	GALNT1, GALNAC-T1, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602273 MGI: 894693 HomoloGene: 8469 GeneCards: GALNT1
Онтологія гена Молекулярна функція • glycosyltransferase activity • polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity • transferase activity • manganese ion binding • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • integral component of membrane • extracellular region • Golgi cisterna membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein O-linked glycosylation via serine • protein O-linked glycosylation via threonine • O-glycan processing • protein O-linked glycosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2589	14423
Ensembl	ENSG00000141429	ENSMUSG00000000420
UniProt	Q10472	O08912
RefSeq (мРНК)	NM_020474	NM_001160404 NM_013814 NM_001361200
RefSeq (білок)	NP_065207	NP_001153876 NP_038842 NP_001348129
Локус (UCSC)	Хр. 18: 35.58 – 35.71 Mb	Хр. 18: 24.34 – 24.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GALNT1 (англ. Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 64 219.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRKFAYCKVV		LATSLIWVLL		DMFLLLYFSE		CNKCDEKKER		GLPAGDVLEP
VQKPHEGPGE		MGKPVVIPKE		DQEKMKEMFK		INQFNLMASE		MIALNRSLPD
VRLEGCKTKV		YPDNLPTTSV		VIVFHNEAWS		TLLRTVHSVI		NRSPRHMIEE
IVLVDDASER		DFLKRPLESY		VKKLKVPVHV		IRMEQRSGLI		RARLKGAAVS
KGQVITFLDA		HCECTVGWLE		PLLARIKHDR		RTVVCPIIDV		ISDDTFEYMA
GSDMTYGGFN		WKLNFRWYPV		PQREMDRRKG		DRTLPVRTPT		MAGGLFSIDR
DYFQEIGTYD		AGMDIWGGEN		LEISFRIWQC		GGTLEIVTCS		HVGHVFRKAT
PYTFPGGTGQ		IINKNNRRLA		EVWMDEFKNF		FYIISPGVTK		VDYGDISSRV
GLRHKLQCKP		FSWYLENIYP		DSQIPRHYFS		LGEIRNVETN		QCLDNMARKE
NEKVGIFNCH		GMGGNQVFSY		TANKEIRTDD		LCLDVSKLNG		PVTMLKCHHL
KGNQLWEYDP		VKLTLQHVNS		NQCLDKATEE		DSQVPSIRDC		NGSRSQQWLL
RNVTLPEIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Meurer J.A., Drong R.F., Homa F.L., Slightom J.L., Elhammer A.P. (1996). Organization of a human UDP-GalNAc:polypeptide, N-acetylgalactosaminyltransferase gene and a related processed pseudogene. Glycobiology. 6: 231—241. PMID 8727794 doi:10.1093/glycob/6.2.231

Див. також

• Хромосома 18