GBP2

GBP2
Ідентифікатори
Символи	GBP2, guanylate binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600412 MGI: 102772 HomoloGene: 10289 GeneCards: GBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • GO:0006184 GTPase activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • Golgi membrane • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма • actin cytoskeleton • клітинне ядро • цитоплазма • комплекс Ґольджі • perinuclear region of cytoplasm • symbiont-containing vacuole membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • interferon-gamma-mediated signaling pathway • protein localization to nucleus • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • defense response to protozoan • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2634	14469
Ensembl	ENSG00000162645	ENSMUSG00000028270
UniProt	P32456	Q9Z0E6
RefSeq (мРНК)	NM_004120	NM_010260
RefSeq (білок)	NP_004111	NP_034390
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.11 – 89.15 Mb	Хр. 3: 142.33 – 142.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GBP2 (англ. Guanylate binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 67 209.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPEINLPGP		MSLIDNTKGQ		LVVNPEALKI		LSAITQPVVV		VAIVGLYRTG
KSYLMNKLAG		KKNGFSLGST		VKSHTKGIWM		WCVPHPKKPE		HTLVLLDTEG
LGDIEKGDNE		NDSWIFALAI		LLSSTFVYNS		MGTINQQAMD		QLHYVTELTD
RIKANSSPGN		NSVDDSADFV		SFFPAFVWTL		RDFTLELEVD		GEPITADDYL
ELSLKLRKGT		DKKSKSFNDP		RLCIRKFFPK		RKCFVFDWPA		PKKYLAHLEQ
LKEEELNPDF		IEQVAEFCSY		ILSHSNVKTL		SGGIPVNGPR		LESLVLTYVN
AISSGDLPCM		ENAVLALAQI		ENSAAVEKAI		AHYEQQMGQK		VQLPTETLQE
LLDLHRDSER		EAIEVFMKNS		FKDVDQMFQR		KLGAQLEARR		DDFCKQNSKA
SSDCCMALLQ		DIFGPLEEDV		KQGTFSKPGG		YRLFTQKLQE		LKNKYYQVPR
KGIQAKEVLK		KYLESKEDVA		DALLQTDQSL		SEKEKAIEVE		RIKAESAEAA
KKMLEEIQKK		NEEMMEQKEK		SYQEHVKQLT		EKMERDRAQL		MAEQEKTLAL
KLQEQERLLK		EGFENESKRL		QKDIWDIQMR		SKSLEPICNI		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Cheng Y.-S.E., Patterson C.E., Staeheli P. (1991). Interferon-induced guanylate-binding proteins lack an N(T)KXD consensus motif and bind GMP in addition to GDP and GTP. Mol. Cell. Biol. 11: 4717—4725. PMID 1715024 DOI:10.1128/MCB.11.9.4717
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Neun R., Richter M.F., Staeheli P., Schwemmle M. (1996). GTPase properties of the interferon-induced human guanylate-binding protein 2. FEBS Lett. 390: 69—72. PMID 8706832 DOI:10.1016/0014-5793(96)00628-X

Див. також

• Хромосома 1