GBP5

GBP5
Ідентифікатори
Символи	GBP5, GBP-5, guanylate binding protein 5
Зовнішні ІД	OMIM: 611467 MGI: 2429943 HomoloGene: 14183 GeneCards: GBP5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • GO:0006184 GTPase activity; • identical protein binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Golgi membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • perinuclear region of cytoplasm;
Біологічний процес	• процес імунної системи; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • inflammatory response; • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly; • protein homotetramerization; • positive regulation of innate immune response; • cellular response to interferon-gamma; • response to bacterium; • protein localization to Golgi apparatus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	115362
	229898
	ENSG00000154451
	ENSMUSG00000105504
	Q96PP8
	Q8CFB4
	NM_052942; NM_001134486; NM_001391920
	NM_153564; NM_212440
	NP_001127958; NP_443174
	NP_705792
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GBP5 (англ. Guanylate binding protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 66 617^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALEIHMSDP	MCLIENFNEQ	LKVNQEALEI	LSAITQPVVV	VAIVGLYRTG
KSYLMNKLAG	KNKGFSVAST	VQSHTKGIWI	WCVPHPNWPN	HTLVLLDTEG
LGDVEKADNK	NDIQIFALAL	LLSSTFVYNT	VNKIDQGAID	LLHNVTELTD
LLKARNSPDL	DRVEDPADSA	SFFPDLVWTL	RDFCLGLEID	GQLVTPDEYL
ENSLRPKQGS	DQRVQNFNLP	RLCIQKFFPK	KKCFIFDLPA	HQKKLAQLET
LPDDELEPEF	VQQVTEFCSY	IFSHSMTKTL	PGGIMVNGSR	LKNLVLTYVN
AISSGDLPCI	ENAVLALAQR	ENSAAVQKAI	AHYDQQMGQK	VQLPMETLQE
LLDLHRTSER	EAIEVFMKNS	FKDVDQSFQK	ELETLLDAKQ	NDICKRNLEA
SSDYCSALLK	DIFGPLEEAV	KQGIYSKPGG	HNLFIQKTEE	LKAKYYREPR
KGIQAEEVLQ	KYLKSKESVS	HAILQTDQAL	TETEKKKKEA	QVKAEAEKAE
AQRLAAIQRQ	NEQMMQERER	LHQEQVRQME	IAKQNWLAEQ	QKMQEQQMQE
QAAQLSTTFQ	AQNRSLLSEL	QHAQRTVNND	DPCVLL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wehner M., Herrmann C. (2010). Biochemical properties of the human guanylate binding protein 5 and a tumor-specific truncated splice variant. FEBS J. 277: 1597—1605. PMID 20180847 DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07586.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19895 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96PP8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 березня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.