GGPS1

GGPS1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Q80
Ідентифікатори
Символи	GGPS1, GGPPS, GGPPS1, geranylgeranyl diphosphate synthase 1, MDHLO, MUDHLOV
Зовнішні ІД	OMIM: 606982 MGI: 1341724 HomoloGene: 31267 GeneCards: GGPS1
шифр КФ	2.5.1.1
Реагує на сполуку
	Геранілгеранілпірофосфат, minodronic acid
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • farnesyltranstransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • dimethylallyltranstransferase activity; • geranyltranstransferase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• cholesterol biosynthetic process; • farnesyl diphosphate biosynthetic process; • geranyl diphosphate biosynthetic process; • geranylgeranyl diphosphate biosynthetic process; • isoprenoid biosynthetic process; • isoprenoid metabolic process; • regulation of cholesterol biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9453
	14593
	ENSG00000152904
	ENSMUSG00000021302
	O95749
	Q9WTN0
	NM_001037277; NM_001037278; NM_004837; NM_001371477; NM_001371478
NM_010282; NM_001331119; NM_001331176; NM_001331177; NM_001331178;
	NM_001331180
NP_001032354; NP_001032355; NP_001358406; NP_001358407; NP_004828;
	NP_001032354.1
NP_001318048; NP_001318105; NP_001318106; NP_001318107; NP_001318109;
	NP_034412
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GGPS1 (англ. Geranylgeranyl diphosphate synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 300 амінокислот, а молекулярна маса — 34 871^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKTQETVQR	ILLEPYKYLL	QLPGKQVRTK	LSQAFNHWLK	VPEDKLQIII
EVTEMLHNAS	LLIDDIEDNS	KLRRGFPVAH	SIYGIPSVIN	SANYVYFLGL
EKVLTLDHPD	AVKLFTRQLL	ELHQGQGLDI	YWRDNYTCPT	EEEYKAMVLQ
KTGGLFGLAV	GLMQLFSDYK	EDLKPLLNTL	GLFFQIRDDY	ANLHSKEYSE
NKSFCEDLTE	GKFSFPTIHA	IWSRPESTQV	QNILRQRTEN	IDIKKYCVHY
LEDVGSFEYT	RNTLKELEAK	AYKQIDARGG	NPELVALVKH	LSKMFKEENE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Kuzuguchi T., Morita Y., Sagami I., Sagami H., Ogura K. (1999). Human geranylgeranyl diphosphate synthase. cDNA cloning and expression. J. Biol. Chem. 274: 5888—5894. PMID 10026212 DOI:10.1074/jbc.274.9.5888
Kainou T., Kawamura K., Tanaka K., Matsuda H., Kawamukai M. (1999). Identification of the GGPS1 genes encoding geranylgeranyl diphosphate synthases from mouse and human. Biochim. Biophys. Acta. 1437: 333—340. PMID 10101267 DOI:10.1016/S1388-1981(99)00028-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kavanagh K.L., Dunford J.E., Bunkoczi G., Russell R.G., Oppermann U. (2006). The crystal structure of human geranylgeranyl pyrophosphate synthase reveals a novel hexameric arrangement and inhibitory product binding. J. Biol. Chem. 281: 22004—22012. PMID 16698791 DOI:10.1074/jbc.M602603200