GPCPD1

GPCPD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Z0B
Ідентифікатори
Символи	GPCPD1, GDE5, GDPD6, PREI4, EDI3, glycerophosphocholine phosphodiesterase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614124 MGI: 104898 HomoloGene: 10478 GeneCards: GPCPD1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoric diester hydrolase activity • glycerophosphodiester phosphodiesterase activity • крохмалеве зв’язування • hydrolase activity • glycerophosphocholine phosphodiesterase activity • carbohydrate binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cellular phosphate ion homeostasis • skeletal muscle tissue development • lipid metabolism • glycerophospholipid catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56261	74182
Ensembl	ENSG00000125772	ENSMUSG00000027346
UniProt	Q9NPB8	Q8C0L9
RefSeq (мРНК)	NM_019593	NM_001042671 NM_001042672 NM_001291050 NM_001291051 NM_001291052 NM_027096 NM_028802 NM_001355648 NM_001355649 NM_001355650 NM_001355651 NM_001355652
RefSeq (білок)	NP_062539	NP_001036137 NP_001277979 NP_001277980 NP_001277981 NP_081372 NP_083078 NP_001342577 NP_001342578 NP_001342579 NP_001342580 NP_001342581
Локус (UCSC)	Хр. 20: 5.54 – 5.61 Mb	Хр. 2: 132.37 – 132.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPCPD1 (англ. Glycerophosphocholine phosphodiesterase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 76 035.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTPSQVAFEI		RGTLLPGEVF		AICGSCDALG		NWNPQNAVAL		LPENDTGESM
LWKATIVLSR		GVSVQYRYFK		GYFLEPKTIG		GPCQVIVHKW		ETHLQPRSIT
PLESEIIIDD		GQFGIHNGVE		TLDSGWLTCQ		TEIRLRLHYS		EKPPVSITKK
KLKKSRFRVK		LTLEGLEEDD		DDRVSPTVLH		KMSNSLEISL		ISDNEFKCRH
SQPECGYGLQ		PDRWTEYSIQ		TMEPDNLELI		FDFFEEDLSE		HVVQGDALPG
HVGTACLLSS		TIAESGKSAG		ILTLPIMSRN		SRKTIGKVRV		DYIIIKPLPG
YSCDMKSSFS		KYWKPRIPLD		VGHRGAGNST		TTAQLAKVQE		NTIASLRNAA
SHGAAFVEFD		VHLSKDFVPV		VYHDLTCCLT		MKKKFDADPV		ELFEIPVKEL
TFDQLQLLKL		THVTALKSKD		RKESVVQEEN		SFSENQPFPS		LKMVLESLPE
DVGFNIEIKW		ICQQRDGMWD		GNLSTYFDMN		LFLDIILKTV		LENSGKRRIV
FSSFDADICT		MVRQKQNKYP		ILFLTQGKSE		IYPELMDLRS		RTTPIAMSFA
QFENLLGINV		HTEDLLRNPS		YIQEAKAKGL		VIFCWGDDTN		DPENRRKLKE
LGVNGLIYDR		IYDWMPEQPN		IFQVEQLERL		KQELPELKSC		LCPTVSRFVP
SSLCGESDIH		VDANGIDNVE		NA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20